Caractérisation moléculaire et pouvoir antagoniste de souches de S. melanosporofaciens, agents potentiels de lutte biologique contre des agents phytopathogènes

Abstract

La souche Streptomyces melanosporofaciens EF-76 est un agent de lutte biologique prometteur et des études antérieures ont montré son aptitude à contrôler la pourriture des racines du framboisier causée par le Phytophthora fragariae var. rubi ainsi, que son aptitude à inhiber la croissance d'une grande variété de bactéries Gram+ et de champignons. Des gènes vraisemblablement impliqués dans la biosynthèse de la geldanamycine ont été isolés chez la souche EF-76. Les évidences expérimentales supportant cette affirmation sont l'identification de la production de geldanamycine comme métabolite secondaire produit par EF-76, la présence parmi les gènes isolés d'une glycosyle transférase impliquée dans la résistance à la geldanamycine et enfin, la corrélation existant entre le phénotype d'une souche mutante sensible à la geldanamycine ne produisant plus l'antibiotique et les délétions qu'elle a subi au sein de ces mêmes gènes. Deux souches recombinantes (FP-54 et FP-60) ont été obtenues par fusion de protoplastes intraspécifique et différaient quant à leurs propriétés antagonistes envers les souches B. cereus ATCC 14579, S. scabies EF-35 et Phytophthora fragariae var. rubi 390. FP-60 avait perdu sa capacité à inhiber la croissance de ces microorganismes alors que FP-54 possédait un plus grand pouvoir d'inhibition de croissance envers ces microorganismes. Alors que FP-60 ne produisait plus de geldanamycine, FP-54 produisait, en plus de la geldanamycine, au moins deux autres composés antimicrobiens absents du surnageant de culture de la souche EF-76. Tout comme la souche sauvage EF-76, FP-54 réduisait les symptômes causés par la gale commune de la pomme de terre mais il n'y avait aucune différence entre les index de la maladie, observés en présence de EF-76 et de FP-54. FP-60 ne possédait aucun effet protecteur contre la gale commune de la pomme de terre. Les résultats obtenus suggèrent que l'antibiose et en particulier la production de geldanamycine par la souche EF-76 est une propriété importante à l'efficacité de cette souche en lutte biologique

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