A finales del año 2002 el H. Congreso de la Unión aprobó el decreto por el que se expidió la Ley Federal para la Administración y Enajenación de Bienes del Sector Público, ello con el objeto de apoyar el cambio en la función pública dirigido a promover la eficiencia y eficacia del Sector Público en el manejo de activos y, en particular, a reducir los costos de administración, operación, custodia, liquidación y enajenación de los bienes a disposición del Gobierno Federal.
El SAE surgió por el esfuerzo del Ejecutivo, a través de la SHCP, para la racionalización de los recursos humanos y materiales del sector público federal, en virtud de que este nuevo organismo incorporó las actividades que desarrollaban varias instancias de la propia SHCP, generando economías de escala en la operación, flexibilidad para el manejo de volúmenes variables y especialización, lo que condujo a la optimización de resultados