Porto, Renan Zanini

Portuguese

Lume 5.8

Evento Salão UFRGS 2019: SIC - XXXI SALÃO DE INICIAÇÃOCIENTÍFICA DA UFRGSAno 2019Local Campus do Vale - UFRGSTítulo Identificação de imprecisões na atribuição taxonômica desequências genômicas de Paenibacillus spp. depositadas noGenbankAutor RENAN ZANINI PORTOOrientador LUCIANE MARIA PEREIRA PASSAGLIAIdentificação de imprecisões na atribuição taxonômica de sequências genômicas de Paenibacillus spp. depositadas no Genbank  Aluno: Renan Zanini Porto Orientadores: Dra. Luciane M. P. Passaglia e Dr. Fernando Hayashi Sant’Anna  Universidade Federal do Rio Grande do Sul  O gênero Paenibacillus é composto por bactérias de vida livre. Algumas de suas espécies são diazotróficas, intimamente associadas a raízes de plantas de importância econômica e promotoras do crescimento vegetal. Por essa razão, esse gênero possui potencial para ser utilizado na agricultura como uma alternativa ecologicamente sustentável aos fertilizantes convencionais. A correta identificação de isolados de Paenibacillus é essencial para orientar seu estudo e uso apropriados. O gene do rRNA 16S é um marcador taxonômico que não apresenta resolução suficiente para discriminar as linhagens de Paenibacillus em nível de espécie. Com o advento das tecnologias de sequenciamento de alto rendimento, surgiu a possibilidade de identificar e classificar organismos por meio de métricas genômicas, como a identidade nucleotídica média (ANI – Average Nucleotide Identity). Análises genômicas demonstram que muitas atribuições taxonômicas não expressam corretamente as relações filogenéticas entre as espécies do gênero Paenibacillus. Em vista disso, o objetivo deste trabalho é validar as atribuições taxonômicas de linhagens do gênero Paenibacillus depositadas no Genbank. Foram adquiridas 439 sequências atribuídas ao gênero Paenibacillus disponíveis no GenBank, e, então, todas foram comparadas entre si através do cálculo do ANI, utilizando o software PYANI. Como referência, foram utilizadas as 129 linhagens-tipo disponíveis, que definem as espécies de Paenibacillus. As linhagens foram classificadas como falso-positivas (FP) quando possuíam nomenclatura igual, mas valor de ANI inferior à 95% (limiar de circunscrição de espécie) em relação a uma linhagem-tipo. Linhagens falso-negativas (FN) apresentavam valores de ANI superiores à 95%, mas nomenclatura diferente em relação à linhagem-tipo. Cerca de seis espécies apresentaram uma taxa de falso-negativos e/ou taxa de precisão relevantes. A espécie Paenibacillus polymyxa, por exemplo, apresentou precisão de 31% e taxa de falsos-negativos de 33%, na atribuição taxonômica de suas linhagens. A espécie Paenibacillus peoriae também apresentou taxas de precisão muito baixas, visto que apenas uma de suas seis linhagens obteve identidade suficiente com a linhagem-tipo. Muitos erros de atribuição foram encontrados no GenBank, portanto, recomenda-se o uso de métricas genômicas para a correta classificação antes de se submeter sequências genômicas a este banco de dados. Apoio financeiro: CNPq 

Identificação de imprecisões na atribuição taxonômica de sequências genômicas de Paenibacillus spp. depositadas no Genbank

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