Porto, Renan Zanini

Portuguese

Lume 5.8

Evento Salão UFRGS 2018: SIC - XXX SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICADA UFRGSAno 2018Local Campus do Vale - UFRGSTítulo Identificação de incongruências na atribuição taxonômica degenomas de Paenibacillus spp.  depositados no GenbankAutor RENAN ZANINI PORTOOrientador LUCIANE MARIA PEREIRA PASSAGLIAIdentificação  de  incongruências  na  atribuição  taxonômica  de  genomas  dePaenibacillus spp.  depositados no GenbankAluno: Renan Zanini PortoOrientadores: Dra. Luciane M. P. Passaglia e Dr. Fernando Hayashi Sant’Anna Universidade Federal do Rio Grande do SulO gênero Paenibacillus é composto por bactérias de vida livre. Algumas de suas espécies sãodiazotróficas, intimamente associadas a raízes de plantas de importância econômica e promo-toras do crescimento vegetal. Por essa razão, esse gênero possui potencial para ser utilizadona agricultura como uma alternativa ecologicamente sustentável aos fertilizantes convencio-nais. A correta identificação de isolados de Paenibacillus é essencial para orientar seu estudoe uso apropriados. O gene do  rRNA 16S é um marcador taxonômico que não apresenta reso-lução suficiente para discriminar as linhagens de Paenibacillus em nível de espécie. Com oadvento das tecnologias de sequenciamento de alto rendimento, surgiu a possibilidade deidentificar e classificar organismos por meio de métricas genômicas, como a identidade nu-cleotídica média (ANI – Average Nucleotide Identity). Análises genômicas demonstram quemuitas atribuições taxonômicas não expressam corretamente as relações filogenéticas entreas espécies do gênero Paenibacillus. Portanto, o objetivo deste trabalho é validar as atribui-ções taxonômicas de linhagens do gênero Paenibacillus depositadas no Genbank. Foram ad-quiridas 319 sequências atribuídas ao gênero Paenibacillus disponíveis no GenBank, e entãotodas foram comparadas entre si através do cálculo do ANI, utilizando o software PYANI. Aslinhagens-tipo, que definem as espécies de Paenibacillus, foram usadas como referência.  Aslinhagens  foram  classificadas  como  falso-positivas  (FP)  quando  possuíam  nomenclaturaigual, mas  valor de ANI inferior à 95% (limiar de circunscrição de espécie) em relação auma linhagem-tipo. Linhagens falso-negativas (FN) apresentavam valores de ANI superioresà 95%, mas nomenclatura diferente em relação à  linhagem-tipo. A espécie  Paenibacilluspolymyxa, por exemplo, apresentou precisão  de 37,5% e e taxa de falsos-negativos de 10%,na atribuição taxonômica de suas linhagens.  Muitos erros de atribuição foram encontradosno GenBank, portanto recomenda-se o uso de métricas genômicas para a correta classificaçãoantes de se submeter sequências genômicas  a este banco de dados.Apoio financeiro: CNPq

Identificação de incongruências na atribuição taxonômica de genomas de Paenibacillus spp.  depositados no Genbank

https://lume.ufrgs.br/bitstream/10183/190997/1/Resumo_58300.pdf

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