Sequencing of cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene and elongation factor 1-alpha (EF1α) gene in aphids of the Belarussian fauna

Abstract

Aim. Cytochrome c oxidase subunit I gene (COI) and elongation factor 1-alpha gene (EF1α) are frequently used for a correct species diagnostics of aphids forms that are correct diagnosis of the species, studying of species genetic structure, assessment of intraspecies and interspecies genetic polymorphism assessment and construction of phylogenetic systems. Methods. Aphids samples were collected in Belarus. Genetic sequences of COI and EF1α genes were sequenced using primes LCO and EF3. Results. Sequences of COI and EF1α genes of 18 aphid species of Belarussian fauna including 6 aphid species of COI gene (Aphis fabae mordvilkoi Börn. & Janisch,, Aphis pomi Deg., Aphis spiraecola Patch, Colopha compressa Koch, Panaphis juglandis (Gz.) и Uroleucon hypochoeridis (F.)) and 15 species of EF1α gene (Anoecia corni (Fabr.), Aphis euphorbiae Kalt., C. compressa, Drepanosiphum platanoidis (Schr.), Gyphina jacutensis Mordv., Hyalopterus pruni (Geoffr.), Longicaudus trirhodus (Walk.), Monaphis antennata (Kalt.), P. juglandis Periphyllus aceris (L.), Schizolachmus pineti (F.), Sipha maydis Pass., Therioaphis tenera Aiz., Trichosiphonaphis corticis (Aiz.), U. hypochoeridis) were obtained. Conclusions. COI gene and EF1α gene sequences were decoded and deposited to GenBank.Цель. Ген субъединица 1 цитохромокси-даза с (COI) и ген субъединица α фактора элонгации (EF1α) применяют для корректной видо-вой диагностики трудно дифференцированных форм тлей, изучения генетической структуры вида, оценки внутривидового и межвидового генетического полиморфизма, а также для построения филогенетических систем. Методы.Образцы тлей собраны на территории Беларуси. Последовательности генов COI и EF1α отсеквенированы с использованием праймеров LCO и EF3. Результаты. Получены нуклеотидные последовательности генов COI и EF1α восемнадцати видов тлей рецентной фауны Беларуси, в частности, гена COI шести видов тлей (Aphis fabae mordvilkoi Börn. & Janisch,, Aphis pomi Deg., Aphis spiraecola Patch, Colopha compressa Koch, Panaphis juglandis (Gz.) и Uroleucon hypo-choeridis (F.)) и EF1α пятнадцати видов тлей (Anoecia corni (Fabr.), Aphis euphorbiae Kalt., C.compressa, Drepanosiphum platanoidis (Schr.), Gyphina jacutensis Mordv., Hyalopterus pruni (Geoffr.), Longicaudus trirhodus (Walk.), Mona-phis antennata (Kalt.), P. juglandis, Periphyllus aceris (L.), Schizolachmus pineti (F.), Sipha maydis Pass., Therioaphis tenera Aiz., Trichosiphonaphis corticis (Aiz.), U. hypochoeridis). Выводы. Последовательности генов COI и EF1α тлей фауны Беларуси расшифрованы и депонированы в GenBank

    Similar works