En numerosas poblaciones a nivel mundial se ha inventariado los perfiles genéticos de los gatos domésticos mediante el uso de los marcadores genéticos del pelaje. En Colombia se han publicado datos de ocho poblaciones. Este estudio presenta el perfil genético de la población de gatos del corregimiento de Capurganá-Chocó frontera con Panamá. Sólo cuatro de los nueve loci evaluados no presentaron fijación de alelos, lo que evidencia la escasa diversidad genética de la población. Sin embargo, se confirmó la existencia de equilibrio Hardy-Weinberg y un elevado índice de Panmixia. El nivel de endogamia de la población es despreciable y el número efectivo calculado es de 20 individuos. Esta población no forma ningún tipo de agrupación sólida con el resto de ciudades colombianas. Migración y deriva genética son discutidos como los factores que han podido influenciar el perfil genético actual