Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020
- Authors
- D. Aanensen
- O. Abdul-Wahab
- A. Abdullaev
- A. Abdurakhimov
- S.W. Aberle
- A.N. Abou Tayoun
- K. Abudahab
- A.G. Adams
- O. Adams
- E.M. Adriaenssens
- A. Advani
- S. Afifi
- B. Agerer
- S.S.Y. Ahmad
- F. Alessandrini
- N.-F. Alikhan
- E. Alm
- A.A. Alsheikh-Ali
- M.H. Andersen
- M. Andersson
- M. Andree
- C. Andres
- A. Angyal
- C. Anthony
- A. Anton
- D.V. Antonets
- M. Antwerpen
- E. Aranday-Cortes
- K. Ariën
- P. Asamaphan
- T. Avši?-Županc
- A.R. Awan
- A. Aydin
- G. Aydin
- G.C. Babinszky
- P. Bagnarelli
- D. Baker
- P. Baker
- J. Ball
- J.D. Barnes
- B. Bartolini
- S. Bashiardes
- M. Bashton
- A. Beckett
- R. Beer
- N. Beerenwinkel
- S. Behillil
- C. Beisel
- M. Belimezi
- A. Bergthaler
- D. Bibby
- K. Bicknell
- K. Bienkowska-Szewczyk
- A. Birchley
- P. Bizta
- H. Blum
- C. Bock
- S.A. Bodnev
- F. Bolt
- D. Bonsall
- V. Borges
- M.A. Bracho
- K. Bragstad
- J. Brandt
- C. Bresner
- A. Briksí
- E.K. Broberg
- S. Broddesson
- A. Broos
- J.R. Brown
- P. Brož
- K. Brunker
- M. Brytting
- D. Buck
- M. Bull
- K. Burián
- E. Butcher
- M.I. Caballero
- L.G. Caller
- I. Cancino-Muñoz
- S. Carbó-Ramirez
- M. Carlile
- S. Carmichael
- M. Carr
- I. Casas
- C. Castilletti
- S. Caucci
- N.S. Cetin
- C. Cevik
- J. Chappell
- D. Chatzidimitriou
- Y. Chaudhry
- A. Chauhan
- Á. Chiner-Oms
- C. Christodoulou
- O. Cinek
- G. Clark
- N. Clementi
- R. Colquhoun
- I. Comas
- T. Connor
- J. Coombs
- S. Corden
- S. Cordey
- N. Cortes
- M. Coscollá
- I. Costa
- S. Cottrell
- E. Csoma
- M.D. Curran
- P. D'Agaro
- G. D'Auria
- P. D?evínek
- A. da Silva Filipe
- D. Dalimova
- A. Darby
- R.K. Davidson
- M. de Cesare
- I.C. de la Plaza
- G. de Marco
- L. de Oliveira Martins
- J. Debebe
- S. Dervisavic
- S. Dervisevic
- R. Dewar
- A. Di Caro
- L. Di Sante
- M. Diaz
- A.T. Dilthey
- G. Dinler-Doganay
- L. Doganay
- F. Donati
- M.Z. Doymaz
- O. Drechsel
- S. Duarte
- N. Duckworth
- G. Dudás
- P. Dyal
- R. Dürrwald
- R. Eccles
- J. Edgeworth
- S. Elliott
- P. Ellonen
- G. Eltringham
- L. Endler
- T. Enkirch
- V. Enouf
- S. Essex
- M. Estee Torok
- M. Evangelidou
- C. Evans
- J. Evans
- M. Exindari
- A. Fadeev
- T. Feldt
- T. Feltwell
- S.M. Fernández
- S.V. Fernández
- P.F. Ferreira
- L. Ferrús-Abad
- J. Findlay
- C. Fisher
- V.M. Fleming
- A. Fomsgaard
- J. Fonager
- L. Forrest
- G. Fournier
- S. Fuchs
- W. Fuller
- F. Földes
- I. Galan-Vendrell
- M.D. Gallagher
- F. Gambaro
- D. Garcia-Cehic
- N. García-González
- A. Gaskin
- B. Gatica-Wilcox
- A. Gavriil
- E.V. Gavrilova
- M.R. Gemmell
- J.-W. Genger
- I. Georgana
- R.P. George
- J. Geryk
- L. Gifford
- L. Gilbert
- R. Gilroy
- G. Gioula
- S. Glaysher
- G.A. Goig
- T. Golubchik
- K. Gombos
- J.P. Gomes
- G. Gonzalez
- F. Gonzalez-Candelas
- I. Goodfellow
- S. Goya
- A. Graf
- J.C. Graham
- L.J. Graham
- D. Grammatopoulos
- A. Green
- L.R. Green
- R. Gregory
- L. Griffith
- D.C. Groves
- C.E. Gruber
- R. Guiomar
- R. Gunson
- V. Gushchin
- A.V. Gutierrez
- A. Gyenesei
- S. Haldenby
- G. Hall
- F.D. Halstead
- W.L. Hamilton
- A.X. Han
- S. Hannula
- E. Harrison
- S. Hauka
- M. Haukland
- R. Herczeg
- V. Hill
- E.B. Hodcroft
- A. Holmes
- N. Holmes
- M. Holub
- C. Holyavkin
- E. Horefti
- M. Hosmillo
- T. Houwaart
- H.C. Howson-Wells
- M. Huber
- P. Hubá?ek
- J. Hughes
- M.A. Hughes
- O. Hungnes
- L. Hülse
- J. Isidro
- M. Iturriza-Gomara
- A. Ivanova
- J. Izopet
- K.P. Jablonski
- B. Jackson
- K.A. Jackson
- A.S. Jahun
- F. Jakab
- B.-E.O. Jensen
- N. Jesudason
- M. Jiménez
- P. Jiménez
- H. Jirincova
- N. Johnson
- I. Jurak
- R. Kalendar
- A. Kalliaropoulos
- H. Kallio-Kokko
- H. Kangas
- E. Karaaslan
- I. Karacan
- T. Karamitros
- M.L. Karlberg
- S.M. Karst
- G.L. Kay
- M. Kašný
- A.J. Keeley
- V. Keitel
- G. Kemenesi
- O.T. Keppler
- M. Khakh
- F. Khokhar
- S.P. Kidd
- D. Kindgen-Milles
- R.A. Kingsley
- R.H. Kirkegaard
- T. Kizilboga-Akgun
- B. Klempa
- P. Klempt
- J. Klovins
- R. Kmiecinski
- S. Knutson
- A. Kolyva
- A.B. Komissarov
- A. Kontou
- D. Koptides
- M. Korva
- A. Kossyvakis
- N. Kotaria
- L. Kramna
- G. Krashias
- S. Krebs
- M. Kristiansen
- A. Kuczmog
- V. Kufner
- S. Kumžiene-Summerhayes
- P. Kvapil
- K. Kvapilová
- V. Labropoulou
- A. Lackenby
- J. Laine
- L. Lambrechts
- Z. Lanszki
- S.L. Larsen
- F. Laubscher
- V. Le-Quy
- J. Ledesma
- R.T. Lee
- A. Lercher
- K.K. Li
- M. Li?ková
- D. Licastro
- S. Liggett
- B. Lindsey
- O.K. Lindsjö
- M.M. Lister
- N.J. Loman
- T. Loney
- M. Loose
- C.E.B. Lopez
- K.F. Loveson
- A. Lucaci
- C. Ludden
- J. Lynch
- M.G. López
- M. Macek
- N.W. Machin
- G. Macintyre-Cockett
- M. Madai
- P. Maes
- A. Mahnic
- D. Mair
- J. Maksimovic
- R.A. Maksyutov
- N. Mancini
- C.F. Manso
- A. Marcello
- A. Marchbank
- B. Martinez-Gonzalez
- J. Martí-Carreras
- L. Martínez-Priego
- A.E. Mather
- S. Maurer-Stroh
- J.L. Mbisa
- K. McCluggage
- J.T. McCrone
- M.P. McHugh
- E.J. Meader
- A. Meijer
- F. Melchionda
- A. Melidou
- K.E. Menger
- A.F. Mentis
- S. Menzo
- L.W. Meredith
- L. Mestek-Boukhibar
- S. Metallidis
- S. Miah
- T.Y. Michaelsen
- J. Michel
- L. Mihaela
- H. Mohamed
- S. Mookerjee
- C. Moore
- C. Moore
- N. Moore
- M. Morgan
- J. Mossong
- M. Muenchhoff
- M. Murtskhvaladze
- A. Nagy
- Á. Nagy
- R.A. Neher
- A. Nelson
- C.A. Nelson
- P.T. Nguyen
- S. Nicholls
- J. Nichols
- M. Niebel
- A. Nitsche
- K. Nomikou
- L. Novakova
- A. Novotný
- N. Nowotny
- J. O'Grady
- Á. O'Toole
- V. Onofri
- A. Ozdarendeli
- N. Pacchiarini
- A.J. Page
- K. Pancer
- Y. Panchbhaya
- S. Pandey
- A. Papa
- H. Papp
- S. Pappa
- M. Parker
- Y.A. Parr
- P.J. Parsons
- D.G. Partridge
- S. Paterson
- C. Patrick Mcclure
- S.T.I. Pavel
- B. Payne
- S.J. Peacock
- P. Pechirra
- M.S. Pedersen
- T. Penz
- C.I. Pereszlényi
- D. Pereyaslov
- A. Perrin
- M. Perry
- C. Petersen
- K. Pfeffer
- N. Phillips
- M.L. Pinckert
- M. Piñana
- S. Platt
- V. Pogka
- K. Polackova
- S. Polesello
- M. Poljak
- A. Popa
- R. Poplawski
- O. Popovici
- S. Posada-Céspedes
- W. Potter
- R. Prakash
- J.R. Price
- T. Pumarola
- O.V. Pyankov
- O. Pybus
- K. Pyrc
- J. Quer
- J. Quick
- L. Rabalski
- C. Ragimbeau
- L. Rainbow
- Y. Ramanculov
- A. Rambaut
- M. Rasmussen
- P.C. Resende
- C. Reusken
- S. Rey
- J. Richter
- S.G. Rimoldi
- D.L. Robertson
- S.C. Robson
- F. Roki?
- F. Romeri
- S. Rooke
- V. Rovite
- W.P.M. Rowe
- S. Roy
- S.J. Rudder
- P. Ruiz-Rodriguez
- L. Ruiz-Roldán
- T. Rukavina
- M. Rupnik
- D. Rus?áková
- C.A. Russell
- P. Ruíz-Hueso
- F. Salerno
- F. Sang
- O. Savicka
- G. Scarlett
- S. Schmutz
- M. Schuster
- T. Schär
- K. Schønning
- P. Selhorst
- M. Senekowitsch
- T. Senff
- M. Sergeeva
- D.K. Sethi
- R. Shah
- A. Shchetinin
- J.G. Shepherd
- A. Shevtsov
- A.N. Shvalov
- E. Simon-Loriere
- T. Sironen
- M.N. Skov
- T. Sloan
- M. Sláviková
- D. Smith
- W. Smith
- K. Smollett
- T. Smura
- M. Smyth
- B. Somogyi
- J.A. Southgate
- K. Spellman
- V.B. Sreenu
- T. Stadler
- R. Stanley
- E. Staro?ová
- P. Stefanelli
- F. Stefani
- K. Stene-Johansen
- J. Stockton
- D. Strelow
- N. Su?i?
- M. Suvanto
- T. Szemes
- E.A. Sørensen
- T. Sørensen
- A. Tagliabracci
- B. Taylor
- S. Taylor
- A.P. Tedim
- G. Terhes
- B. Tesovic
- The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group.
- E. Thomson
- N.M. Thomson
- A. Thürmer
- E. Tichá
- J. Timm
- J.A. Todd
- L. Tong
- I. Topolsky
- M. Torres-Puente
- A. Trebes
- T.V. Tregubchak
- L. Trgovec-Greif
- A. Trkola
- A.J. Trotter
- C. Tryfonos
- T. Tsoleridis
- R. Tucker
- C. Turchi
- S. Turdikulova
- L. Turtle
- H.J. Tutill
- G.E. Tóth
- A. Underwood
- P. Urbán
- M. Ustinova
- M.A. Uygut
- E.E. Vamos
- S. van der Werf
- B. Vanmechelen
- O. Vapalahti
- M.K. Vasconcelos
- J. Vecerova
- H. Vennema
- D. Vidanovic
- L. Vieira
- T.L. Viet
- J. Virtanen
- J. Volkening
- M. von Kleist
- A. Voulgari-Kokota
- O. Vugrek
- A. Walker
- S. Walsh
- M.C. Walter
- J. Watkins
- T. Wawina-Bokalanga
- M. Wedde
- M. Whitehead
- A.K. Wienecke-Baldacchino
- T. Wienemann
- C.A. Williams
- R. Williams
- R.J. Williams
- T.C. Williams
- A. Wittner
- T. Wolff
- T. Workman
- V. Wright
- M. Wyles
- S. Yadahalli
- A. Yakovleva
- M. Yasir
- M.K. Yazici
- C. Yeats
- H. Yetiskin
- W.C. Yew
- G.R. Young
- Á. Zaballos
- M. Zaheri
- M. Zajac
- S. Zakotnik
- B. Zana
- S. Zeghbib
- T.M. Zorec
- N.S. Zuckerman
- Publication date
- 1 January 2020
- Publisher
- Doi
Abstract
We show the distribution of SARS-CoV-2 genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three available genomic nomenclature systems for SARS-CoV-2 to all sequence data from the WHO European Region available during the COVID-19 pandemic until 10 July 2020. We highlight the importance of real-time sequencing and data dissemination in a pandemic situation. We provide a comparison of the nomenclatures and lay a foundation for future European genomic surveillance of SARS-CoV-2.Peer revieweSimilar works
Available Versions
Last time updated on 21/02/2023
Last time updated on 01/05/2021
Last time updated on 10/12/2020
Last time updated on 15/07/2021