Identificación y caracterización in silico de péptidos potencialmente antigenicos de Toxoplasma gondii con afinidad al HLA-DR&1

Abstract

Introducción: La Toxoplasmosis es una parasitosis con una prevalencia mundial del 40% que es causada por Toxoplasma gondii y pese a que la mayoría de hospederos humanos controlan la infección, pueden llegarse a presentar complicaciones incapacitantes como la toxoplasmosis ocular, cerebral, ganglionar y diseminada; principalmente en individuos inmunosuprimidos o infectados congénitamente. Debido a esto y a la falta de un tratamiento efectivo contra la enfermedad, se han tomado diversos caminos para hallar una vacuna. Entre estos se destaca la identificación mediante herramientas bioinformáticas de péptidos de Toxoplasma gondii presentados a través del HLA-I, los cuales tienen la capacidad de inducir una respuesta inmune con predominio de linfocitos T CD8+, en individuos que manifiestan la infección crónica asintomática. Sin embargo, este método no se ha utilizado con el objetivo de estimular la actividad de los linfocitos T CD4+ que normalmente orientan la respuesta inflamatoria, controlan su intensidad y apoyan el establecimiento de una memoria inmunológica. Objetivos: Identificar y caracterizar in silico péptidos derivados de proteínas de Toxoplasma gondii con afinidad hacia más del 40% de los alelos prevalentes de HLA-DRβ1. Metodología: Se utilizó un método de búsqueda con múltiples herramientas bioinformáticas que incluían la base de datos de Toxoplasma gondii ToxoDB para la selección de proteínas e identificación de sus características moleculares, NetMHCII pan 3.2 para predicción de péptidos de unión a HLA-II, AllerTOP 2.0 para determinar alergenicindad de los mismos y Protparam para estimar algunas de características fisicoquímicas como la hidropatía, la vida media y la estabilidad Resultados: A partir de 9 péptidos iniciales, se obtuvo 4 candidatos provenientes de un antígeno de superficie (LAG1) y procesos metabólicos (Nucleasa S1/P1 y poli(ADP-ribosa)-glicohidrolasa). Compuestos de 15 aminoácidos, con probable unión a al menos el 57.8% de los alelos de DRβ1 en la población general, conservados entre cepas de Toxoplasma gondii y con poca probabilidad de comportarse como alérgenos. Conclusión general: En este estudio, utilizando una estrategia racional mediante herramientas de biología computacional, se logró identificar 4 péptidos de Toxoplasma gondii con una afinidad a al menos el 57.8% de los alelos mas prevalenetes de cada grupo de HLA-II DRβ1, que constituyen elementos importantes para futuros experimentos en busca de un posible candidato vacunal.1. Introducción. ........................................................................... 9 2. Objetivos. ............................................................................... 12 3. Marco Teórico. ........................................................................ 13 4. Materiales y métodos. ............................................................. 25 5. Resultados. ............................................................................. 31 6. Discusión. ............................................................................... 42MaestríaMagíster en Ciencias Biomédica