Methods of transmission electronic microscopy, electron diffraction, energy dispersive X-ray microanalysis have been used for investigations of element composition, regularities in structural and phase transmissions occurring in thin-filmed systems Si–Fe–Si and TiN–Ti–Si while using impulse photon annealing in terms of radiation energy density. Optimum parameters of impulse photon annealing for formation of β-FeSi2 and C54-TiSi2 thin films on silicon have been determined in the paper.Методами просвечивающей электронной микроскопии, электронографии и энергодисперсионного рентгеновского микроанализа проведены исследования элементного состава, закономерностей структурных и фазовых превращений, происходящих в тонкопленочных системах Si–Fe–Si и TiN–Ti–Si при импульсном фотонном отжиге в зависимости от плотности энергии облучения. Определены оптимальные параметры импульсного фотонного отжига для формирования на кремнии тонких пленок FeSi2 β-модификации и TiSi2 в модификации C54