La composición florística encontrada en el presente trabajo estuvo representada mayoritariamente por los grupos Chlorophyta, Cyanophyta y Bacillariophyta, conteniendo principalmente altas densidades poblacionales con pocas especies. Dentro de las comunidades encontradas las cyanophyta fueron las más representativas en los cuatro ríos estudiados. Las comunidades fitoplanctónicas encontradas en el estudio mostraron una baja diversidad y una dominancia numérica de las especies representativas del grupo de las cyanophyta. Sin embargo el río Mayales baja su nivel de agua durante la época seca, llegando hasta secarse en algunos tramos, originando parches de agua estancada con muy poca profundidad, favoreciendo la presencia de la especie Aulacoseira granulata en la muestra. El río Acoyapa estuvo representado mayormente por el grupo de las cyanophyta con las especies. Cylindrospermopsis raciborsskii y Lyngbya limnetica en los ríos Oyate y Tepenaguasapa cambió su dominancia porcentual por Cyclotella meneghiniana y para el mes de julio por la especie Synedra ulna y el género Nitzschia sp. La aplicación del índice de Shannon y Weaver (1949) demostró que el nivel de calidad de agua de los cuatro ríos en este estudio se encuentran ligeramente contaminado
