The distribution of genotype of the Hepatitis C virus (HCV) RNA positive patients

Abstract

Amaç: Flaviviredea ailesinden bir virus olan Hepatit C virusu(HCV) akut hepatitlerin %20’si, kronik hepatitlerin % 70’inden sorumludur. HCV’nin genotip tayini tedavide ve klinik sürecin takibinde önemlidir. Çalışmamızda Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji laboratuarına kan örnekleri gönderilen 34 HCV RNA pozitif hastada genotip dağılımının saptanması amaçlanmıştır. Yöntem: Örneklerin genotiplendirilmesinde Geno Sen’s HCV Genotyping 1/2/3/4 Real Time PCR Reagents Kiti (Corbett Research, Australia) kullanılmıştır. Hastaların viral yükleri 34x103 ile 17x106 arasında bulunmuş olup viral yük ortalamaları ise 46x105 olarak saptanmıştır. Çalı- şılan 34 örnekten 31’i genotip 1, 3’ü genotip 4 olarak bulunmuştur. Sonuç: Sonuç olarak klinik sürecin takibi ve antiviral tedavi seçiminde genotip tayinin yol gösterici olması sebebiyle bu tip çalışmaların önemli olduğu düşünülmektedir.Objective: Hepatit C virus (HCV), which is a virus from the family Flaviviredea, is responsible for 20% of acute hepatitis and 70% of chronic hepatitis. Determination of HCV genotype is important in the treatment and the clinical follow-up process. In this study, we aimed to determine the genotype distribution of 34 HCV RNA positive patients whose sera were sent to Afyon Kocatepe University, Faculty of Medicine Microbiology laboratory. Method: Geno Sen’s HCV Genotyping 1/2/3/4 Real Time PCR Reagents Kit (Corbett Research, Australia) was used for genotype determination of those samples. Patients’ viral loads were found between 34x103-17x106 and mean viral load was 46x105. Thirty one samples, out of 34, were found genotype 1 while the other 3 samples were found genotype 4. Results: Consequently, this type of studies are considered to be crucial since genotype determination has a guiding role in clinical follow-up process and the selection of antiviral therapy