Physical fitness supervised by Physical Education professionals inserted in a rehabilitation program for patients with neuromuscular and musculoskeletal disorders aims to increase muscle strength, improve motor coordination, dynamic balance, aerobic capacity, functional capacity and health-related physical fitness. This is an important intervention to prevent and mitigate the synergy between loss of physical function and exacerbation of various comorbidities that compromise functional independence, modify risk factors, increase quality of life and longevity with reduced mortality. The aim of this paper is to present the assistance protocol of the Physical Conditioning Service of the Institute of Physical Medicine and Rehabilitation of the Clinical Hospital of the University of São Paulo Medical School (IMREA-HCFMUSP), designed for the intervention of physical exercises, respecting the profile and physical limitations of these patients, as well as observing their clinical markers.O condicionamento físico supervisionado por profissionais de Educação Física inserido em um programa de reabilitação para pacientes com distúrbios neuromusculares e musculoesqueléticos visa o aumento da força muscular, melhora da coordenação motora, equilíbrio dinâmico, capacidade aeróbia, capacidade funcional e da aptidão física voltada à saúde. Trata-se de importante intervenção para prevenir e atenuar a sinergia entre a perda de função física e a exacerbação de várias comorbidades que comprometem a independência funcional, modificar fatores de risco, aumentar a qualidade de vida e longevidade com redução da mortalidade. O objetivo desse artigo é apresentar o protocolo de assistência do Serviço de Condicionamento Físico do Instituto de Medicina Física e Reabilitação do Hospital das Clinicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (IMREA-HCFMUSP), elaborado para que a intervenção de exercícios físicos seja adequada, respeitando o perfil e limitações físicas desses pacientes, bem como na observação de seus marcadores clínicos
