W pracy przedstawiamy wybrane elementy analizy profilu
ekspresji raka brodawkowatego tarczycy, przeprowadzonej
przez nas u 16 chorych na raka brodawkowatego tarczycy.
U wszystkich z nich przeprowadzono dwa badania profilu
ekspresji - jedno w RNA izolowanym z guza, drugie w
RNA izolowanym z niezmienionej makroskopowo tkanki
tarczycy. Badanie przeprowadzono na mikromacierzach
oligonukleotydowych wysokiej gęstości HG –U133A
zawierających 22 tysiące ludzkich genów, selekcjonując
przy użyciu programu MAS 5.0 110 genów, których
ekspresja była w znaczący sposób zmieniona we wszystkich
16 parach. Dalszej analizie poddano wybrane 3 geny - gen
peptydazy dipeptydylowej IV (DPP4), gen fibronektyny 1
(FN1) oraz gen tkankowego inhibitora metaloproteinazy
typu 1 (TIMP1). DPP4 - RNA był praktycznie nieobecny
w tkankach zdrowych, natomiast w tkankach raka brodawkowatego tarczycy był wykrywany w bardzo dużej
ilości. Pozostałe dwa geny wykazały znaczącą ekspresję w
tkance zdrowej i jej bardzo wyraźne wzmocnienie w raku
tarczycy. Dlatego spośród tych trzech genów największe
znaczenie jako marker raka brodawkowatego tarczycy na
poziomie RNA wydaje się mieć gen DPP4.In our study we present chosen elements of microarray
analysis of gene expression profile in papillary thyroid
cancer. The study group included 16 papillary thyroid
cancer tissues and 16 corresponding normal tissues.
Samples were analyzed on high density oligonucleotide
microarrays (GeneChip HG-U133A) which contain
22.000 genes. 110 genes, which had significant changed
expression, were selected by MAS 5.0 program. 3 genes
were chosen to the deeper analysis: dipeptidylpeptidase
4 (DPP4), fibronectin 1 (FN1), tissue inhibitor of
metalloproteinase 1 (TIMP1). DPP4-RNA were absent
in normal tissue while in cancer tissue it was detected in
large amount. FN1 and TIMP1 expression were detected
in normal tissue but markedly increased in papillary
thyroid cancer. Among these 3 genes DPP4 seems to be
the best molecular marker for papillary thyroid cancer
