dockingstudyofhdacimplicationforbenzamideinhibitorsbindingmode

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Publication date
1 January 2004
Publisher

Abstract

通过计算机模拟的对接过程研究，发现了MS-275——一种苯甲酰胺类的组蛋白去乙酰酶(HDAC)抑制剂与酶的可能的全新结合方式．这种结合方式与已经阐明的组蛋白去乙酰酶类似蛋白(HDLP)与曲古柳菌素A(trichostatin A，TSA)和suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)形成的复合物晶体结构中配体与酶的作用方式完全不同．从对接结果看，MS-275的作用靶点在酶活性口袋的最狭窄部位，而不是直接作用于锌离子．这似乎能够解释MS-275的低毒性特点，并且为设计和筛选全新的HDAC抑制剂提供了新思路

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