'Ege Universitesi Turk Dunyasi Incelemeleri Dergisi'
Abstract
Bağlantı dengesizliğine (Linkage Disequilibrum, LD) dayanan ilişki haritaları, kantitatif özellik lokusu (Quantitative Trait Locus, QTL) haritalarına alternatif ve önemli özellikleri kontrol eden genlerin belirlenmesinde etkili bir metotdur. Bu çalışmada 66 fasulye genotipi kullanılmış ve 233 Amplified Fragment Lenght Polymorphism (AFLP), 105 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ve 80 Simple Sequence Repeat (SSR) markırı analiz edilmiştir. Bu populasyonda LD ve populasyon yapısı belirlenmiştir. Tüm genomu kapsayacak şekilde yüksek LD değeri saptanmıştır (r2 ≥0.1, p<0.01). STRUCTURE programında populasyon yapısı belirlenmiştir ve 66 fasulye genotipi kendi arasında 7 (K=7) ana gruba ayrılmıştır. TASSEL (Trait Analysis by aSSociation, Evolutionand Linkage) programında Genel Lineer Model (General Linear Model, GLM) metodu kullanılarak markır ve 5 fenotipik özellik (liflilik özelliği, tohum taslağı sayısı, bitki tipi, bitki büyüme şekli ve çiçeklenme zamanı) arasında ilişki saptanmıştır. Beş fenotipik özellik ile ilişkili toplamda 62 markır önemli olarak belirlenmiştir (r 2 ≥0.1, p<0.01). Bu çalışma ile ilk kez 66 fasulye genotipi arasında ilişki haritası yapılmıştır. Fasulyede yapılan bu ilişki haritalama çalışması QTL haritalama metodlarına alternatif olacaktır
