Tutkimustyöllä on perusterveydenhuollossa vähemmän perinteitä kuin erikoissairaanhoidossa. Terveyskeskuksissa tehdään toistaiseksi harvoin esimerkiksi väitöskirjaan johtavia tutkimuksia. Kuitenkin vuonna 2011 voimaan tulleessa terveydenhuoltolaissa tutkimustyö määriteltiin ensi kerran myös terveyskeskusten perustehtäväksi. Tutkimustyön avulla voidaan kehittää perusterveydenhuollon menetelmiä ja käytäntöjä sekä lisätä alan arvostusta. Tutkimustyö terveyskeskuksessa vaatii johdon tukea sekä yhteistyöverkostoja yliopistoon, perusterveydenhuollon yksikköön ja erikoissairaanhoitoon. Aihe kannattaa valita siten, että sille on olemassa paikallista mielenkiintoa ja tukea. Tutkimuksen esteitä voidaan poistaa varautumalla jo suunnittelussa henkilöstövaihdoksiin, resurssi- ja potilaspulaan. Monikeskustutkimukset ja terveyskeskusten välinen yhteistyö takaavat riittävän aineiston kertymisen. Parhaimmillaan tutkimustyö tuo innostusta terveyskeskusten toimintaan, sitouttaa ja kouluttaa henkilöstöä sekä edistää näyttöön perustuvien käytäntöjen juurtumista
