Modelación de la tasa de intercambio del agua en el agente de contraste bioactivado [Gd (DOTA-FPG) (H2O)], con uso en la identificación de expresión génica en células cancerígenas
Objetivo: modelación de la tasa de intercambio de agua para agentes bioactivados utilizados en resonancia magnética nuclear, técnica implementada en medicina con fines de diagnóstico y tratamiento para identificar expresiones génicas en células cancerígenas.Utilizando dinámica molecular atomística se puede extraer dos de los tres parámetros que determinan cuan eficiente es un agente de contraste. La dinámica molecular (DM) constituye una excelente herramienta para evaluar agentes de contraste in-silico. Se utiliza el software LAMMPS para estudiar compuestos químicos (agentes de contraste), implementado en el cluster HPCC (High Performance Computing Clusters) que cuenta con 8 nodos, sistema operativo GNU/Linux, capacidad de almacenamiento IDE o ATA: velocidad de 66MB/s, ubicado en la Universidad San Francisco de Quito. En este caso particular utilizando [Gd(DOTA-FPG)(H2O)], como modelo, y substituyendo el ion de Gd por Ca se ha encontrado que el aumento de relajación de protones está dado por el ion (calcio), campo aplicado (interno y externo), metabolismo del cuerpo humano, pH, enzima de uso y a su vez la relaxividad. En la medición de la tasa de intercambio de agua a 2.5 Å llamada primera esfera encontramos una presencia de 1 moléculas de agua que interactúan con el agente de contraste para cumplir su función. Al comparar los valores modelados de tasas de intercambio de agua con valores experimentales podemos concluir estableciendo un método de screening para nuevos agentes basados en este parámetro y en otros que se pueden calcular a partir de los mismos resultados. Se recomienda para su cálculo simular con cuidado el movimiento de las moléculas de agua y estilo alrededor del agente de contraste validando la variación de tasa de intercambio de agua de un complejo bioactivado de Gd (agente de contraste que adicionalmente de mejorar la resolución de la imagen, se activa en el sitio en el que está presente una enzima como substrato
