Thole, Bernard Theodoor

Dutch

ARTS repository - University of Groningen

   University of GroningenAll but tediousThole, Bernard TheodoorIMPORTANT NOTE: You are advised to consult the publisher's version (publisher's PDF) if you wish to cite fromit. Please check the document version below.Document VersionPublisher's PDF, also known as Version of recordPublication date:1982Link to publication in University of Groningen/UMCG research databaseCitation for published version (APA):Thole, B. T. (1982). All but tedious: Quantumchemistry and biomolecules. s.n.CopyrightOther than for strictly personal use, it is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of theauthor(s) and/or copyright holder(s), unless the work is under an open content license (like Creative Commons).The publication may also be distributed here under the terms of Article 25fa of the Dutch Copyright Act, indicated by the “Taverne” license.More information can be found on the University of Groningen website: https://www.rug.nl/library/open-access/self-archiving-pure/taverne-amendment.Take-down policyIf you believe that this document breaches copyright please contact us providing details, and we will remove access to the work immediatelyand investigate your claim.Downloaded from the University of Groningen/UMCG research database (Pure): http://www.rug.nl/research/portal. For technical reasons thenumber of authors shown on this cover page is limited to 10 maximum.Download date: 08-06-20222 t .  L -E .  Su t t d r ,  ' l ab l es  o f  I n t e ra tom ic  d i s t ances " ,Special  publ icat ion Nfq,  The Chemical  Society,Iondo, 1955.22 .  P .Th .  van  Du i j nen  and  B .T .  Tho le ,  Che rn .  Phys .  Le t t .8 3 ,  r 2 9  ( r 9 8 r ) .23.  P.Th.  van Dui jnen and B,T.  Thole,  submit ted forpubl lcat ion.2{ .  I { .  Remko and p.Th.  van Dui inen,  to be publ i .shed.SAMEWATTINGBerekening van de invloed van het  e lectr ische veld vaneen hel ix  op de plaats van een proton in het  act ieve cen-trum van papaine, van d.e invloed daarop van de polariseer-baarheid van de otngevingf, het construeren daarvoor van eenhamiltoniaan die behalve lnductie ook dispersie bevat, hetaflelden dat deze dispersie een bovengrens geeft voor deechte 4lspersie, het maken van een trpdel voor het berekenenvan de polarlseerbaarheden van moleculen net zo weinig nbge-Ij. jk paranEters, het nadendn over de mogelijkheid dat hetinwendige van een hel ix ,  met z i jn e lectr lsche veld,  geschikt-zaL zLjn als kanaal voor het transporteren van lonen, vooralprotonen, het  ontrderpen van een populat ieanalyse selke metrdein ig moei te atoonladingen geeft  d ie zowel  bruikbaar z i j *b i j  het  analyseren van t rends 1n resul taten van gol fnrecha-nische berekenlngen a1s voor het  berekenen van het  u i threndigeelectrische veld van een tnolecuul en het- bepalen van ge-schikte p laatsen voor react ie met qroepen die posi t ievedan wel  negat ieve J.ading zoeken; a l  deze onderwerpen,schi jnbaar zonder veel  onder l ing verband, zL)n in €€n z insamen te vat ten.  Ze zL)n al lemaa1 bedoeld 6f  om theoretente helpen bi j  hun r^rerk aan biomoleculen,  6f  om biochemicite helpen hun werk zel f  te doen.A I I e  t ekenen  w i j zen  e rop  da tvan  Cys25  on tdaan  i s  van  z i j nin papaine het  zwavelatoomDro ton  doo rda t  he t  e l ec t r i s che@{JJveld van de heLix hern in de r icht ing van een st j .kstof  atoonin de r ing van HisI59 duwt.  Di t  dulren r"rordt  geholpen doorde polar iseerbaarheid van de omgeving.  Het achterbl l jvendenegat ieve zrdavelatoom is sterk nucleof ie l  en het  bewusteproton kan later  gebruikt  worden om de pept idebinding vanhe t  t e  sp l i t sen  subs t raa t  t e  he lpen  b reken .De  d i r ec te  r eac t i eve ld  han i l t on i aan  gee f t  de  po la r i sa t i edoor een wi l lekeur ig gevormd nolecuul  van een wi l lekeur iggevormde omgeving.  Door deze polar isat ie rechtstreeks inde hami l toniaan oD te nemen kr i jgen we ook de dispersie-wisselvrerk ing.  Di t  is  gedemonstreerd in een berekeningvan de krachten waalmee twee watermoleculen elkaar aantrek-ken .  Me t  d i t  mode l  i s  he t  moge l i j k  i n  go l fmechan i kabe re -ken ingen ia l l e r l e i  e f f ec ten  mee  t e  nemen  d i e  van  be langz i j n  i n  zee r  g ro te  mo lecu len ,  zoa l s  de  b i omo l -ecu len .Het model  voor de polar iseerbaarheid van molekulen kangez ien  wo rden  a l s  een  ee rs te  s t ao  b i j  he t  be rekenen  vanpo la r i sa t i eE f f ec ten  op  de  Cou lonbene rg ie  van  s tukkene iw i t .  Deze  kunnen  i n t e ressan t  z i j n  i n  b i j voo rbee ld  dehe l i x -  en  be taD laa t s t r uc tu ren .  De  popu la t i eana l yse  kangeb ru i k t  wo rden  om be te re  a toom lad ingen  t e  k r i j gen  danve rk regen  we rden  me t  de  Mu l l i ken  ana l yse .  Da t  kan  van  paskomen  b i j  mo lecu la i r e  dynam ica  en  ene rg iem in ima l i sa t i e -be reken ingen .  Bovend j -en  kunnen  be te re  I ad j , ngen  m isch ienb e t e r  r e a c t i e m e c h a n i s m e s  s u q g e r e r e n .AIs de hel ix  inderdaad ionen kan t ransporte len hebben wemischien de oplossing in handen van een reeks interessanteproblernen,  Het zou een mooie i l lustrat ie z i jn van decordate manier  waarop de natuur haar zaken vaak regel t .@F

All but tedious:Quantumchemistry and biomolecules

https://pure.rug.nl/ws/files/14479605/Thole.PDF

All but tedious:Quantumchemistry and biomolecules

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

ARTS repository - University of Groningen