Marcozzi, Alessio

English

Het eerste gedeelte van de scriptie betreft het onderzoek naar de toepassing van phage display, om korte aptamers te selecteren voor zeer verschillende moleculen.Door deze techniek te gebruiken hebben we een peptide kunnen selecteren die de bateriele enzym dxs in-vitro verhinderd. Dit soort peptide realiseert een begin voor de ontwikkeling van nieuw soort antibiotica.Wederom, door de toepassing van phage display, hebben we een bibliotheek van circulaire peptides die CB8 tegengaan bekeken. Dit zijn macrocyclische moleculen met de bekende eigenschap dat ze complexen vormen met N-terminal aromatische aminozuren. Met dit onderzoek, laten we voor het eerst zien dat CB8 complexen kan vormen met cyclische peptiden.Naast phage display, benoemen we ook de toepassing van genetische gemodificeerde virus capsid als een veel beloofde bouwsteen voor liquid crystals. Hiernaast hebben we het major coat protein ook succesvol genetisch geengineerd (p8) van M13 voor de aanpassing van de chemisch-fysieke eigenschappen van het materiaal. Als laatst, melden we de resultaten van een uitgebreide bacteriële activiteitstest waaraan verschillende nieuwe aminoglycoside antibiotica zijn onderworpen. Deze zijn geproduceerd met verschillende benadering, waaronder de door ons ontwikkelde “aptameric protective groups” technologie.This work explores the application of filamentous bacteriophages (bacterial viruses) in different scientific fields including materials science and drug development.In the first part of this thesis, we investigate the application of “phage display” to select short aptamers against very different molecules. Using this technique, we have selected a peptide that can inhibit a the bacterial enzyme DXS in-vitro. Such a peptide represent a starting point for the development of a new antibiotic.Again, using phage display, we screened a library of circular peptides against CB8, a macrocyclic molecule known to form complexes with N-terminal aromatic amino acids. With this study, we show, for the first time, that CB8 can form complexes with cyclic peptides.Aside from phage display, we address the use of a genetically modified virus capsid as a promising building block for the realization of liquid crystals. We have successfully applied genetic engineering of the major coat protein (p8) of M13 to modify the chemo-physical properties of the bulk material.Finally, we report the results of an extensive antibacterial activity test performed on several new aminoglycoside antibiotics produced using different approaches, including the “aptameric protective groups” technology developed in our group

ARTS repository - University of Groningen

Harnessing phages for supramolecular and materials chemistry

https://pure.rug.nl/ws/files/32453340/Complete_thesis.pdf

Harnessing phages for supramolecular and materials chemistry

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

ARTS repository - University of Groningen