To contribute to the design of a plan of handling for transgenic genotypes, agreed with the environmental conditions of the Sinú valley, will allow the optimization of the use of this technology. It is of interest to establish a line base of handling information for the transgenic cotton genotypes by means of the evaluation of system of efficient and profitable farming in the use of the varieties RR and Bt. The work was made in the C.I. Turipaná, a design of divided parcels was used (factors: farming and variety), three replicates. The height of the plant was lower in the conventional system farming, the conditions of movement of the ground in direct seedtime did not allow to greater conservation of the stored water and growth in the cotton plants. The height was not affected by the variety. The number of branches, specks, retention of structure by position and sites with abortion of fruits were not affected by the factors analyzed nor its interaction. The varieties Opal Delta and NuOpal were superior in yields to the presented/displayed ones by variety RR. This difference of the yield was possibly due to the effect of the gene incorporated in the variety RR on the physiology of the plant. Direct seedtime presented/displayed favorable conditions such as greater humidity retention so that a greater weight of speck is expressed. Economically the best treatment was direct Sowing of Opal Delta with a rate of marginal return of 18,4%.Contribuir al diseño de un plan de manejo para genotipos transgénicos, acorde con las condiciones ambientales de la zona del Valle del Sinú, permitirá la optimización del uso de esta tecnología. Es de interés establecer una línea base de información de manejo de los genotipos transgénicos de algodón mediante la evaluación de sistema de labranza eficiente y rentable en el uso de las variedades RR (Roundup Ready) y Bt ( Bacillus thurigiensis). El trabajo se realizó en el C.I. Turipaná, se utilizó un diseño de parcelas divididas (factores: labranza y variedad), con tres repeticiones. La altura de la planta fue menor en el sistema de labranza convencional, las condiciones de la siembra directa permitieron mayor conservación de agua almacenada en el suelo y crecimiento de las plantas. La altura no fue afectada por la variedad, el número de ramas, motas, retención de estructura por posición y sitios con aborto de frutos no fueron afectados por los factores analizados ni su interacción. Las variedades Delta Opal y NuOpal fueron superiores en rendimientos a los presentados por la variedad RR; esta diferencia del rendimiento se debió posiblemente al efecto que produce el gen incorporado en la variedad RR sobre la fisiología de la planta. La siembra directa presentó condiciones favorables tales como mayor retención de humedad para que se exprese un mayor peso de mota en las variedades evaluadas. Económicamente el mejor tratamiento fue siembra directa con material Delta Opal con una tasa de retorno marginal de 18,4
