Ympäristöministeriö asetti Laboratorion tiedonhallintajärjestelmäprojektin (Lims- projektin) 20.4.1999. Hankeorganisaatioon kuuluivat ohjausryhmä, projektiryhmä ja projektin koordinoimat työryhmät. Ohjelmistoksi valittiin Whitelake Software Point Oy:n LimsBoss. Projektin työn tuloksena saatiin ympäristöhallinnolle yhtenäinen ja toimiva järjestelmä, joka mahdollistaa aikaa säästävät ja virheettömät tiedonsiirrot näytteenoton suunnittelusta näytteiden kirjaukseen, tietojen siirtämisen mittalaitteen ja Lims- järjestelmän välillä sekä tulosten siirron asiakkaille ja kohdetietokantoihin. Järjestelmä mahdollistaa myös monipuoliset tietohaut ja raporttien laatimisen Limsiin tallennetuista tiedoista helppokäyttöisen raporttityökalun (Business Objects) avulla.
Ohjelmiston kehittämisen ja testauksen pilottiyksiköinä olivat Suomen ympäristökeskus (SYKE) ja Länsi-Suomen ympäristökeskus (LSU). Kaikki ympäristökeskukset ottivat kehitetyn järjestelmän käyttöön vuoden 2001 loppuun mennessä. Kattavalla Lims- järjestelmän käytöllä voidaan paremmin täyttää laatujärjestelmien vaatimukset sekä vapauttaa henkilöstöä monipuolistuvan tehtäväkentän tarpeisiin ja menetelmien kehittämiseen.
Ohjelmiston tekninen toimivuus ja luotettavuus on ollut erittäin hyvä ottaen huomioon useat hankitut lisätoiminnot, ohjelmiston käytön laajuus ja käyttöönottoaikataulun nopeus.
Ympäristöhallinnon laboratoriotoiminta on edelleen dynaamisen kehitys- ja muutostyön alaisena. Hankittu Lims- järjestelmä on todettu toimivaksi myös muuttuvissa olosuhteissa. Järjestelmän on arvioitu kattavan hyvin laboratorioiden ja näytteenoton suunnittelun tarpeet vielä vuosiksi eteenpäin. Lims- järjestelmän asiakaskohtaisesta jatkokehityksestä vastaa ympäristöministeriön nimittämä kehittämisryhmä yhdessä ohjelmatoimittajan kanss
