Analyse génétique et relations phylogénétiques du cheval Barbe par l’utilisation des microsatellites

Abstract

The aim of this study was to compare genetically Moroccan (MA) and Tunisian (TN) Barb horses and toe stablish the phylogenic relation between Barb horse and other horse breeds in Morocco by using microsatellites. First, 100 Moroccan barb and 100 Tunisian Barb horses were used. Genetic variability index between and inside the populations were estimated. 133 alleles were detected in the Moroccan population and 125 in the Tunisian. The mean number of alleles was 7.29 and 7.82 respectively for the Tunisian and Moroccan barb horse. The heterozygosity was almost similar in the two groups of Barb horses (TN = 0.716 and MA = 0.714). Fst was estimated at 0.0454 and 0.0780 respectively for TN and MA Barb horses. The Gst was also estimated at 0.012 and the Nei genetic distance at 0.05. The two populations are almost genetically similar and heterogeneous. Finally, 86,5 % of horses were correctly affected to their likelihood population. Secondly, 50 Arabian horses, 50 Arabian-Barb and 50 thoroughbreds and the 200 Barb horses previously studied were used to establish the phylogenic relationships. The use of 17 microsatellites showed that the Barb horses had specific alleles and the highest heterozygosity and the highest genetic distances were obtained with thoroughbred. The two Barb horse populations were highly combined in one side of the phylogenic tree. Key words: horse, barb, genetic analysis, microsatellites, genetic index, phylogenic treeCe travail s’est intéressé à la comparaison génétique entre les chevaux Barbes du Maroc et de Tunisie et à l’établissement des relations phylogénétiques entre le cheval Barbe et les autres races de chevaux existantes au Maroc par l’utilisation des microsatellites. Premièrement, 100 chevaux barbes marocains et 100 tunisiens ont été utilisés et les indices de la variabilité intra et inter-population ont été évalués. 133 allèles ont été détectés pour le Barbe marocain contre 125 pour le tunisien. Le NMA était de 7,29 et 7,82 respectivement chez le Barbe tunisien et marocain. Les taux d’hétérozygotie moyens étaient presque similaires chez les deux populations. Le Fst était de 0,0454 et 0,0780 respectivement chez le Barbe de Tunisie et du Maroc. Le Gst était très faible et la distance génétique de Nei était de 0,05. Les deux populations sont donc hétérogènes et pratiquement identiques. 86,5% des individus étudiés ont été affecté convenablement à leur population d’origine. Deuxièmement, 50 chevaux Arabe, 50 Arabe-Barbe et 50 Pur-Sang, en plus des 200 chevaux Barbes préalablement étudiés ont été utilisés. Le cheval barbe a présenté des allèles spécifiques et une forte hétérozygotie avec une distance génétique maximale avec le Pur-Sang. L’arbre phylogénétique a montré, un regroupement très significatif entre les deux populations Barbes d’un côté et les trois autres races de l’autre. Mots clés : cheval, Barbe, analyse génétique, microsatellites, indices de variabilité génétique, arbre phylogénétiqu

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