The use of “omics” techniques in combination with model systems and molecular tools allows to understand how foods and food components act on metabolic pathways to regulate transcriptional processes. Polyunsaturated fatty acids have distinctive nutritional and metabolic effects because they give rise to lipid mediated products and affect the expression of various genes involved in intestinal inflammation. The present review focuses on the molecular effects of dietary polyunsaturated fatty acids on intestinal inflammation.El uso de técnicas «omic» en combinación con sistemas modelo y herramientas moleculares nos permiten entender como los alimentos y sus componentes actúan en las rutas metabólicas que regulan los procesos transcripcionales. Los ácidos grasos poliinsaturados tienen efectos nutricionales y metabólicos diferenciadores porque producen una elevación de los productos regulados por lípidos y afectan a la expresión de varios genes involucrados en la inflamación intestinal. La presente revisión se enfoca en los efectos moleculares de los ácidos grasos poliinsaturados de la dieta en la inflamación intestinal