Dahyot, S

François, P

Guennoun, C

Lebeurre, J

Pestel-Caron, M.

Tournier, I

French

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HAL Id: hal-02265853
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Caractérisation du Système de Sécrétion Ess/Type VII
de Staphylococcus lugdunensis
J Lebeurre, S Dahyot, C Guennoun, I Tournier, P François, M. Pestel-Caron
To cite this version:
J Lebeurre, S Dahyot, C Guennoun, I Tournier, P François, et al.. Caractérisation du Système de
Sécrétion Ess/Type VII de Staphylococcus lugdunensis. Journée Normande de Recherche Biomédicale,
Sep 2016, Rouen, France. ￿hal-02265853￿
Il s’agit maintenant de déterminer si le locus ess est organisé en une structure opéronique et d’évaluer l’éventuel impact de l’insertion du
transposon sur l’expression du TS7 par des méthodes de qPCR. Il s’agira également d’étudier le rôle du locus ess dans la virulence de
S. lugdunensis par l’étude de la capacité d’un mutant délété du gène essC à sécréter les toxines EsxA et EsxB, dans un modèle d’infection du
nématode Caenorhabdditis elegans.
Caractérisation du Système de Sécrétion Ess/Type VII de 
Staphylococcus lugdunensis
Lebeurre J1, Dahyot S1, Guennoun C1, Tournier I2, François P3, Pestel-Caron M1
1GRAM EA2656, IRIB, Université de Rouen Normandie, Rouen, France ; 2Inserm UMR U1079, IRIB, Université de Rouen Normandie, Rouen, France ; 
3Genomic Research Laboratory, Geneva University Hospital, Geneva, Switzerland
Staphylococcus lugdunensis est un Staphylocoque à Coagulase Négative (SCN), commensal de la peau et des muqueuses de l’Homme, dont
le pouvoir pathogène est plus proche de celui de Staphylococcus aureus que des autres SCN. En effet, le nombre et la sévérité des infections
à S. lugdunensis décrits dans la littérature en témoignent. Toutefois, aucune donnée moléculaire n’explique à ce jour une telle pathogénicité.
Le Système de sécrétion Ess/Type VII (TS7) a été décrit chez plusieurs espèces bactériennes telles que Mycobacterium tuberculosis ou
S. aureus et joue un rôle dans l’excrétion de toxines putatives (EsxA et EsxB) via la protéine EssC formant un pore à travers la membrane.
Chez ces espèces, le TS7 s’est révélé essentiel à la virulence ; une délétion du locus ess chez S. aureus affecte la capacité de la souche
mutante à développer des abcès dans un modèle murin et à persister dans l’organisme hôte. Ainsi, la présence du TS7 chez
S. lugdunensis, seul SCN à posséder le locus ess complet, a mené à la description de son organisation génomique et à sa caractérisation.
L’analyse bio-informatique a permis d’identifier chez les 6 souches de S. lugdunensis une région comprenant des gènes homologues de
ceux codant les principales protéines du TS7 chez S. aureus (Module 4), suggérant une fonction similaire. Plusieurs autres gènes codant des
protéines accessoires de fonctions inconnues (Module 1 et 3) ont aussi été identifiés. Ces dernières contiennent des ‘’Domains of Unknown
Function‘’ conservés, identifiés chez d’autres espèces bactériennes telles que S. aureus (DUF600, DUF 5079, DUF5080, DUF 5082), en lien
avec le TS7. Par ailleurs, un polymorphisme de taille du locus ess a été observé, allant de 27 kb à 38 kb avec un nombre variable de
séquences codantes selon les souches. Ce polymorphisme est lié à la présence de 8 séquences codantes supplémentaires (Module 3) chez les
souches SL29 et SL122, mais également à l’insertion d’un transposon chez 3 souches de ST1 (Module 2) situé entre les gènes codant les
protéines accessoires et ceux codant les principales protéines du TS7. Ce dernier s’est inséré au sein d’un gène codant une protéine
possédant un domaine DUF600, protéines identifiées dans une région hypervariable du locus ess chez S. aureus.
Figure 1: Représentation schématique de l’organisation génomique du locus ess chez les 6 souches de S. lugdunensis séquencées par la technique Pacific Biosciences SMRT.
Afin d’identifier des déterminants potentiels de la virulence chez S. lugdunensis, les génomes de 3 souches pathogènes et 3 souches isolées en
situation de portage, de différents Sequence Type (ST), définis par MultiLocus Sequence Typing, ont été séquencés par la technique Pacific
Biosciences SMRT. Les génomes complets circularisés ont été annotés avec le logiciel RAST et alignés avec le programme MAUVE. Les
identités génomiques des séquences codantes du locus ess ont été évaluées par BLAST.
Introduction
Matériels & Méthodes
Résultats
Conclusion


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