In addition to zoonotic potential, Chlamydia (C.) abortus is a very important bacterium causing serious disease in small ruminants. The main outcome of the disease is abortion in the late stages of pregnancy and the economic impact for farms is significant. During a three-year period (2015–2017), 191 vaginal swabs, 24 placentas, 210 foetal organs and 2 milk samples from small ruminant abortion cases were tested for C. abortus by real-time PCR. Positive samples were detected on eight sheep farms and two goat farms, with 8.4% of total samples testing positive samples. These samples were characterised using the
MLVA method, and a single MLVA genotype (genotype [2]) was identified from sheep and goat samples, suggesting highly conserved C. abortus strains among the national flock. This study is the first description of C. abortus as a causative agent of abortion in goats in Croatia. More detailed study is required to recognize the epidemiological relevance of the abortion chlamydiosis. An open register of farms with defined health status should be established for each farm at the national level for better disease(s) control.Osim zoonotskog potencijala, vrsta Chlamydia (C.) abortus je vrlo važna bakterija koja može prouzročiti tešku bolest malih preživača. Dominantni klinički znak bolesti je pobačaj u kasnom stadiju graviditeta sa znatnim ekonomskim učinkom za farme. Tijekom trogodišnjeg razdoblja (2015.-2017.) metodom Real time (RT) PCR na C. abortus testiran je 191 vaginalni obrisak, 24 placente, 210 organa fetusa i 2 uzorka mlijeka iz slučajeva pobačaja malih preživača. Pozitivni uzorci ustvrđeni su u 8 farmi ovaca i 2 farme koza, što ukupno predstavlja 8,4 % pozitivnih uzoraka. Ovi uzorci su tipizirani metodom MLVA i identificiran je jedinstveni genotip MLVA (genotip [2]). Dobiveni rezultat ukazuje na visok stupanj podudarnosti sojeva C. abortus u nacionalnom stadu ovaca i koza. Ovo istraživanje prvi je opis vrste C. abortus kao uzročnika pobačaja u koza u Hrvatskoj. Temeljem ustvrđenog rezultata bilo bi uputno provesti daljnja, detaljnija istraživanja da bi se prepoznalo epidemiološko i ekonomsko značenje infekcija vrstom C. abortus. Radi kvalitetnijeg nadzora bolesti potrebno je uspostaviti otvoreni registar gospodarstava s definiranim zdravstvenim statusom za svaku pojedinu farmu
