Les GIST bénéficient d'un intérêt tres récent qui va de paire avec leur définition exacte et l'introduction du Glivec en 2000, ce qui ne permet pas de proposer une standardisation formelle des pratiques. Le diagnostic sur ponction réalisée sous échoendoscopie est possible dans la mesure où les prélèvements obtenus permettent une recherche de l'immunoexpression de KIT, voire une recherche de mutations spécifiques