O estudo teve como objetivo avaliar a influência da irrigação do canal radicular com hipoclorito de cálcio [Ca(OCl)2] na concentração de 5,25%, associado ao EDTA, sobre o componente inorgânico da dentina em comparação com o hipoclorito de sódio (NaOCl) na mesma concentração. Para tanto, o terço médio e apical de 60 raízes de pré-molares humanos foram divididos aleatoriamente em seis grupos (n=10): Ca(OCl)2 5,25%; Ca(OCl)2 5,25% + EDTA 17%; NaOCl 5,25%; NaOCl 5,25% + EDTA 17%; EDTA 17%; soro. As amostras foram irrigadas com as soluções prédeterminadas conforme o protocolo de irrigação e, a seguir, foram seccionadas longitudinalmente em duas hemi-raízes. Uma das metades foi utilizada para a análise em microscopia eletrônica de varredura (MEV). Imagens dos túbulos dentinários no sentido longitudinal e transversal, na região do lúmen do canal, foram obtidas. Os túbulos dentinários, na secção transversal, foram analisados em relação à remoção da smear layer e da alteração da dentina peritubular Os dados foram submetidos ao teste de Kruskall-Wallis, seguido pelo post-hoc de Dunn (α=.05). Os resultados da análise em MEV dos túbulos no sentido longitudinal foram apresentados descritivamente, de acordo com o arranjo dos túbulos: paralelos ou divergentes. Os grupos EDTA, Ca(OCl)2 + EDTA e NaOCl + EDTA mostraram diferença significativa na remoção da smear layer e alteração no componente inorgânico da dentina quando comparados aos grupos soro, Ca(OCl)2 e NaOCl no terço médio do canal. No terço apical, apenas o grupo NaOCl+EDTA mostrou diferença significativa quando comparado aos grupos soro, Ca(OCl)2 e NaOCl. A avaliação dos túbulos no sentido longitudinal mostrou que nos grupos soro, Ca(OCl)2 e NaOCl os túbulos apresentavam-se obliterados por smear layer e com um arranjo paralelo. No grupo do EDTA, a smear layer foi removida e os túbulos apresentaram arranjo paralelo. Nos grupos Ca(OCl)2 + EDTA e NaOCl + EDTA a smear layer foi removida e os túbulos mostraram arranjo divergente.The present study aimed to evaluate the influence of irrigation of the root canal with calcium hypochlorite [Ca(OCl)2] 5,25%, followed by EDTA, on the inorganic component of dentin compared with sodium hypochlorite (NaOCl) at the same concentration. Thus, the middle and apical third of 60 human premolar roots were randomly divided into six groups (n=10): 5,25% Ca(OCl)2; 5,25% Ca(OCl)2 + 17% EDTA; 5,25% NaOCl; 5,25% NaOCl + 17% EDTA; 17% EDTA; saline solution. The samples were irrigated with predetermined irrigation solutions according to the protocols. The specimens were split longitudinally and only one half was used for the analysis in scanning electron microscopy (SEM). Images of dentinal tubules in longitudinal and transverse direction in the canal lumen were obtained. Tubules in transverse direction were analyzed according to the smear layer removal and alteration of peritubular dentin. Data were submitted to the Kruskall Wallis test, followed by Dunn`s test (α=.05) The results of SEM analysis of dentinal tubules in the longitudinal direction were presented descriptively, according to the arrangement of the tubule: parallel or divergent. EDTA, Ca(OCl)2 + EDTA and NaOCl + EDTA groups showed statistically significant difference in the removal of smear layer and alterations in dentine inorganic component when compared to saline, Ca(OCl)2 and NaOCl groups in the middle third of the canal. However, when observing the apical third, only NaOCl + EDTA group showed statistically significant difference when compared to saline, Ca(OCl)2 and NaOCl groups. The evaluation of the tubules, in longitudinal direction, showed that in the saline, Ca(OCl)2 and NaOCl groups tubules were obliterated by smear layer and showed parallel arrangement. EDTA group was able to remove smear layer and the tubular arrangement was parallel. Ca(OCl)2 + EDTA and NaOCl + EDTA groups removed the smear layer and provided a divergent tubular arrangement