Differential profile analysis of glycan expression in human glycoproteins — Application to Epithelial Ovarian Cancer (EOC) studies

Abstract

La glycosylation des protéines est essentielle dans de nombreux mécanismes cellulaires. Au cours de la cancérogenèse, l'expression des glycanes varie et ces changements peuvent modifier leur structure et leur fonction. Ces dernières années, la glycobiologie a pris de l'importance dans la recherche sur le cancer en raison de l'association potentielle de l'expression aberrante des glycanes avec diverses pathologies. Les variations sont principalement liées aux modifications structurelles des N-glycanes et des O-glycanes et plus particulièrement visibles dans leurs motifs terminaux (glycoépitopes/déterminants des glycanes). La relation entre les déterminants des glycanes et le cancer avait déjà été identifiée au début du 20e siècle, mais leur pertinence en tant que cibles thérapeutiques potentielles n'a été concrètement révélée que récemment. Afin d'évaluer le rôle des déterminants des glycanes, nous avons d'abord extrait les informations fonctionnelles de la littérature, puis comparé les données expérimentales issues des études publiées sur le profil des lignées cellulaires néoplasiques pour analyser l'expression des glycanes et par la suite identifier leurs caractéristiques discriminantes. Nous avons utilisé un logiciel récemment publié dédié au support du glyco-profilage des protéines et des tissus. Les résultats de ce logiciel fournissent des liens potentiels permettant la découverte de nouveaux biomarqueurs pour la détection précoce du cancer. Dans le présent travail, l’application est centrée sur des données du cancer des ovaires