Questo lavoro si propone di estrarre informazioni su molecole biologiche fissate su un substrato utilizzando la microscopia AFM. Il limite naturale di questa microscopia è dato dagli effetti distorsivi della convoluzione punta-campione. Per superare questo limite, il presente lavoro propone un aproccio inverso rispetto a quelli classici; Invece di operare direttamente sull’imaging molecolare si costruisce un modello della molecola e viene simulata la microscopia, introducendo le distorsioni tipiche dell’AFM. Il confronto (basato sulla mutua informazione) viene reiterato raffinando ad ogni iterazione i parametri iniziali. La simulazione della microscopia afm comprende la ricostruzione del tip