Targeting integral membrane proteins in quantitative proteomics for medical applications and biotechnological issues by $\textit {Corynebacterium glutamicum}$ and $\textit {Escherichia coli}$

Abstract

Es wurden bestehende Methoden für die Shotgun-Proteomics genutzt und in Bezug auf die herausfordernde Analyse von Membranproteinen optimiert. Diese Methodenentwicklung ermöglichte es, umfassende Proteomstudien zu biotechnologisch relevanten Fragestellungen zu bearbeiten. Der Schwerpunkt dieser Arbeit befasst sich mit Quantitativer Membranproteomanalytik. Dazu wurde ein Membranprotein-Anreicherungsverfahren, das Biphasische System, etabliert und gezeigt, dass sich dieses auch zur relativen Quantifizierung eignet. Hierbei erfolgten die globale Analyse des L-Lysin-Produzenten im Vergleich zum Wildtyp von $\textit {C. glutamicum}$ und die Anpassung von $\it {C. glutamicum}$ bei Salzstress. Darüber hinaus wurde die medizinische Grundlagenforschung vorangetrieben, indem insbesondere die Erforschung der neuartigen Antibiotikagruppe der kleinen Metall-konjugierten Peptide erfolgte. Die in diesen globalen Studien weiterführenden Fragen wurden zusätzlich mit biochemischen und biophysikalischen Methoden geklärt