Usporedba statističkih klaster metoda u analizi proteina elektroforezom

Abstract

Standard electrophoresis methods were used in the qualitative and quantitative protein analyses of cerebrospinal fluid (CSF). Disc electrophoresis was carried out for detection of oligoclonal IgG bands in cerebrospinal fluid on polyacrylamide gel. Pairs of CSF and serum were taken from 30 patients, mainly with multiple sclerosis and other central nervous system dysfunctions, polyradiculoneuritis, known as Guillain-Barre syndrome, encephalitis, paraproteinemia, and analyzed. ImageMaster 1D Elite and GelPro specialized software packages were used for fast accurate image and gel analysis. The results obtained from different hierarchic cluster analysis methods were compared. In some cases, despite substantial similarities between electropherograms, different cluster methods produced different dendrograms. Therefore, the cluster analysis should be used cautiously. It offers only additional diagnostic information on the inflammatory conditions of the central nervous system.Standardne metode elektroforeze upotrebljene su u kvalitativnoj i kvantitativnoj analizi proteina cerebrospinalne tekućine (CSF). Detekcija oligoklonalnih IgG proteina u cerebrospinalnoj tekućini provedena je disk elektroforezom na poliakrilamidnom gelu. Analizirani su uzorci CSF i seruma od 30 pacijenata s multiplom sklerozom i drugim oboljenjima središnjeg živčanog sustava kao što su poliradikuloneuritis, poznat kao Guillain-Barre sindrom, encefalitis i paraproteinemia. ImageMaster 1D Elite i GelPro specijalizirani kompjutorski programi upotrebljeni su za brzu analizu slike i gela. Usporedbom rezultata dobivenih iz različitih hijerarhijskih klaster analiza utvđeno je da različite klaster metode ne daju iste rezultate. Usprkos sličnostima elektroferograma različite klaster metode u nekim slučajevima daju različite dendrograme pa je potreban oprez u interpretaciji rezultata. Klaster analiza daje samo dodatne dijagnostičke informacije o upalnom stanju središnjeg živčanog sustava

    Similar works