La pasteurelosis neumónica es una de las enfermedades que tiene mayor impacto económico en la producción del ganado ovino en todo el mundo y una de las más importantes enfermedades en la etapa neonatal. M. haemolytica y P. multocida son los principales agentes bacterianos asociados a estos procesos en los pequeños rumiantes. El objetivo principal de este estudio fue la caracterización genética de los aislados de M. haemolytica y P. multocida asociados a las lesiones neumónicas características de la pasteurelosis neumónica en ovino con la finalidad de contribuir a la mejora del diagnóstico y del diseño de vacunas para la prevención de estos procesos en ovino. Para ello se utilizaron técnicas de tipificación molecular como el “multilocus sequence typing” (MLST), electroforesis de campo pulsado (PFGE) y los perfiles de virulencia (“virulotyping”).En los 121 aislados de M. haemolytica analizados se detectaron un total de 12 STs mediante MLST. Los STs más frecuentes fueron ST16 (50/121; 41,3%), ST 28 (29/121; 24,0%) y ST8 (19/121; 15,7%). Las diferencias en las frecuencias y distribución de ST entre aislados de pulmones con y sin lesiones neumónicas no fueron estadísticamente significativas (P> 0.05). Estos tres STs representan el 27% de los aislados de oveja, el ST16 y ST8 representan casi un tercio de los aislados de cabra incluidos en la base de datos MLST de M. haemolytica lo que indica una amplia distribución de estos genotipos en pequeños rumiantes. Además, esto unido a que estos STs no se han identificado en aislados bovinos sugiere la adaptación de ciertos linajes genéticas de M. haemolytica a pequeños rumiantes..