Concebidos como «nuevos riesgos», los OMG agrícolas activan una dinámica política y social que tiene repercusiones sobre el proceso político-científico de toma de decisiones. Este artículo explora esta dinámica en un doble nivel, europeo y catalán. En el primer caso, el análisis se centra en la regulación de OMG, identificando los factores que explican su resultado final. En el segundo, el diagnóstico de la polarización del debate evidencia la existencia de procesos subyacentes, determinantes para la discusión. Estos procesos (lenguajes distintos y debate sobre el modelo agroalimentario) responden a la existencia de sistemas de valor contrapuestos y marcan la dinámica del conflicto.Conceived as «new risks», agricultural GMOs activate a political and social dynamic with effects over the political-scientific decision-making process. This paper explores this dynamic in a double level, European and Catalan. In the first case, GMOs regulation is analysed, identifying the factors that explain its result. In the second case, the diagnosis of a polarized debate shows the existence of underlying processes, determinant for the discussion. These processes (different languages and debate on the agri-food model) are due to the existence of opposed value systems and they condition the dynamics of the dispute