Isolamento di marcatori molecolari per la valutazione della qualità in rucola

Abstract

Metodi rapidi e non distruttivi sono necessari per valutare la qualit\ue0 dei prodotti di quarta gamma lungo la catena produttiva che va dalla raccolta alla conservazione. La qualit\ue0 dei prodotti vegetali in post-raccolta non pu\uf2 essere migliorata, ma soltanto preservata, l\u2019identificazione di marcatori molecolari pu\uf2 essere utile nel determinare la minima variazione di qualit\ue0 fin dal primo giorno di conservazione. L\u2019obiettivo del nostro lavoro \ue8 quello di isolare marcatori molecolari utilizzando una strategia di sequenziamento dell\u2019RNA (RNA-seq). La rucola (Diplotaxis tenuifolia L.) coltivata in floating system \ue8 stata sottoposta a diversi tipi di stress abiotici. In pre-raccolta sono stati imposti stress salino (200\u2009mM NaCl), stress radicale da alte temperature (40\ub0C), carenza di nitrati (assenza di NH4+/NO3-), mentre in post-raccolta \ue8 stato imposto stress da freddo (4\ub0C), taglio e perdita di acqua. Il campionamento delle piante \ue8 stato effettuato dopo 24 ore. L\u2019RNA totale \ue8 stato estratto dai campioni stressati e dal controllo e sequenziato tramite Illumina HiSeq\u2122 2000. L\u2019RNA-seq ha permesso di isolare quei geni la cui espressione \ue8 specifica per ogni stress oltre a quelli la cui espressione \ue8 comune a tutti gli stress. Tali geni codificano per proteine associate alla senescenza, a processi degenerativi e a perdita di qualit\ue0 e, pertanto, vengono considerati come marcatori di qualit\ue0. I risultati di RNA-seq saranno validati tramite PCR quantitativa e i livelli di espressione genica saranno monitorati in diverse condizioni durante il periodo di conservazione della rucola. L\u2019espressione dei potenziali marcatori durante la conservazione sar\ue0 correlata con le variazioni dei principali parametri qualitativi. The research leading to these results has received funding from the European Union Seventh Framework Programme (FP7/2007-2013) under grant agreement n. 289719 (Project QUAFETY