thesis

A mass spectrometry study of compounds with environmental and biological interest

Abstract

Tese de doutoramento, Química (Química Analítica), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2010The leading thread of this work is the application of Mass Spectrometry to the study of environmental and biological relevant compounds. Several studies were performed involving the development and optimization of efficient analysis methodologies, the behaviour of the compounds under study was investigated using various mass spectrometry techniques and fundamental studies were carried out, most of them complemented with semi-empirical calculations. Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI) has been extensively used for the analysis of large molecules. Nevertheless, since the technique provides soft and efficient ionization of thermolabile and non-volatile organic compounds, we decided to investigate its application to small molecules as an alternative ionization method. For that we compared the performance of nanosized TiO2 anatase as matrix with that of common organic matrices. The formation of organic matrix-flavonoid cluster ions was also investigated and it was found to be dependent of the structure of the flavonoid. Aniline derivatives are of great industrial importance and several constitute a significant group of pollutants. The gas-phase behaviour of halo- and nitroanilines under electrospray ionization mass spectrometry conditions was studied. Isomer identification methodologies are proposed using for that purpose competitive fragmentations of protonbound heterodimers. Preliminary results on the behaviour of the aniline derivatives when subjected to electron capture dissociation conditions are presented and discussed. The behaviour of five isoflavones was studied under electrospray ionization mass spectrometry in the positive ion mode. The fragmentation mechanisms were proposed taking into account MSn experiments, accurate mass measurements and semi-empirical calculations. Some of the fragmentations were found to be dependent on the substitution pattern of the B-ring and the ions afforded by these fragmentations can be considered as diagnostic ions. Several newly synthesized -lactones, fused or C-C linked to sugar rings, were studied. Their fragmentation mechanisms were proposed taking into account MSn experiments and semi-empirical calculations. FTICR-MS; ESI; MALDI; Fragmentation Mechanisms; Collision Induced DissociationEste trabalho tem como domínio comum a aplicação da Espectrometria de Massa ao estudo de vários compostos com interesse ambiental e biológico. Foram realizados estudos que envolvem o desenvolvimento e optimização de metodologias eficientes de análise; foi investigado o comportamento dos compostos em estudo usando várias técnicas de espectrometria de massa e foram realizados estudos de natureza fundamental, a maioria dos quais complementados por cálculos semi-empíricos. Concretamente: Ionização/desorção laser assistida por matriz (MALDI) é uma técnica de ionização muito usada na análise de moléculas com massas moleculares elevadas. No entanto, a sua capacidade de ionizar de um modo suave e eficiente compostos não voláteis e termicamente instáveis levou-nos a investigar a sua aplicabilidade à análise de moléculas pequenas. Para tal, comparou-se a performance da fase anatase do TiO2 com a de matrizes orgânicas convencionais na ionização de vários compostos cobrindo várias classes. Um dos compostos em particular, um flavonóide, formou iões agregados com a matriz orgânica, o que nos levou a aprofundar o estudo deste comportamento. Conclui-se que a estrutura do flavonóide influencia a formação dos iões agregados. Derivados de anilina têm uma grande importância a nível industrial e os derivados halogenados, em particular, constituem um grupo de poluentes bastante significativo. Assim, estudou-se o comportamento em fase gasosa de halo- e nitroanilinas com o intuito de estabelecer mecanismos de fragmentação e metodologias que permitam a identificação de isómeros. Para a identificação de isómeros recorreu-se a fragmentações competitivas de heterodímeros ligados por protão. Também são apresentados e discutidos resultados preliminares sobre o comportamento de derivados de anilina quando expostos a condições de dissociação por captura de electrões. O comportamento de cinco isoflavonas foi estudado no modo positivo e recorrendo à espectrometria de massa com ionização por electrospray. Foram propostos mecanismos de fragmentação tendo em conta experiências de espectrometria de massa tandem, medições de massa exacta e cálculos semi-empíricos. Algumas das fragmentações observadas são dependentes do anel B e dos seus substituintes e, como tal, os iões originados por estas fragmentações podem ser considerados como iões diagnóstico. Várias -lactonas fundidas ou ligadas a açúcares, compostos recentemente sintetizados, foram estudadas com o intuito de estabelecer mecanismos de fragmentação. Tal foi feito tendo em conta dados de espectrometria de massa tandem e cálculos semi-empíricos. FTICR-MS; ESI; MALDI; Mecanismos de Fragmentação; Dissociação Induzida por ColisãoThe work presented in this thesis was performed in the Environmental and Biological Mass Spectrometry Group, Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, with the financial support of Fundação para a Ciência e a Tecnologia (SFRH/BD/27614/2006

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