The Virtual Observatory (VO) got started by Big Science projects. We can ask: is the VO an exclusive tool to handle big catalogs from large surveys? We think the VO should contain information from journals, other publications, and non-survey, ``Little Science" observations too. Journals, observatory publications and repositories could be the vehicle to carry non-survey observations to the VO

Holl, András

English

Repository of the Academy's Library

LISA V ­ Library and Information Services in Astronomy VCommon Challenges, Uncommon SolutionsCambridge, Ma, 2006draft of the paper submitted for the proceedingsASP Conference Series, Vol. 377, proceedings of the conference held 18­21 June 2006 in Cambridge, Massachusetts, USA. Edited by Sandra Ricketts, Christina Birdie, and Eva Isaksson., p.47               Observations and publications in the VO:                  is the VO only for Big Science?                           A. Holl              Konkoly Observatory, Budapest, HungaryAbstract The Virtual Observatory (VO) got started by Big Science projects. We can ask:is the VO an exclusive tool to handle big catalogs from large surveys?We think the VO should contain information from journals, other publications,and non­survey, "Little Science" observations too. Journals, observatorypublications and repositories could be the vehicle to carry non­surveyobservations to the VO.Is the VO applicable for Big Science data only?Big Science is where the VO was born. Handling Big Science data is relatively easy for the VO: surveys yield large quantities of uniform data. Big Science projects usually have large budgets and it is easy to incorporate meta­data into the process.But what about "Little Science"? Would not it be a loss for the astronomicalcommunity if data from small projects did not get into the VO? We think thatthe small could be important. An argument for building the VO is thatthe secondary use of data means greater efficiency in terms of scientificresults for the same investment. If efficiency is important, we can notafford to lose even the smallest bit of good quality research data.The loss of visibility resulting from possible exclusion from the VOwould be grossly unfair too. C. Sterken deals with the questions ofBig Science and Little Science Sterken (2000), and quotes Weinberg(1961):"We must make Big Science flourish without, at the same time, allowing it to trample Little Science ­ that is, we must nurture small­scale excellence as carefully as we lavish gifts on large­scale spectaculars."But there are other, maybe more importantarguments in favor of including small project data in the VO data pool.These data are mostly good quality (of course, regarding onlydata which have gone through peer review or other quality controlalready): they are hand­made (hand­reduced) by experts. All the smallobservatories, and small astronomical projects together might add up toa large survey. With exponentially growing data volume it is true that new big projectdata quickly outgrow the existing ones ­ but the time dimension matters! We cannot repeat lost observations even with the most modern instruments.Data resulting from small projects could be important in filling the"information gaps".What vehicles could carry small project data to the VO?We can see four possibilities: journals, observatory publications, repositories and annotation of databases.  ­ JournalsPublications and the data they are based on must be both accessible tothe reader and the referee. Of course, it could be accomplishedby referring the data in a public archive. Standards are suggested forthis by Accomazzi (2004). In turn, databases should contain links to the publication based on a given dataset too.Data associated with papers published in A\&A are stored at CDS ­VO inclusion is solved in this case.Journals themselves could store observational data. This is the casefor the small journal "Information Bulletin on Variable Stars". IBVSalready uses some VO techniques Holl (2004b), and we intend toadd more such features.Journals, of course, contain data besides observational data files.How could these data get into the VO? Presently, information in thejournal articles will get into Simbad or other databases manually.We think with some modification of the way astronomy papers arecoded, it will be possible to harvest the data in published articlesautomatically.Fig. 1. Information published in IBVS is entered todatabases and bibliographies ­ a process which could be automated.We think that journal articles should be readable not only for humans,but machines as well. At this point, as a thought experiment, we canconsider changing the data format of the scientific papers from thepresent LaTeX and PostScript (for figures) to XML. Transforming theideas of Donald Knuth for literate programming (Knuth 1984), wecan envision a scientific paper, where text, data and figures arecoded in a way which, if processed for the human reader, would resultin a nicely typeset paper. On the other hand, all the tablesand figures would be machine­readable. The difficulty is, of course,that we would need proper tools not only to format these papers,but to prepare the manuscript as well. The advantage would bethat information from such papers could be channeled to databasesmore easily, and there would be no more need for retrieving data froma published figure using a ruler. A further advantage could be, as Knuth described, the improved quality of the papers, becausethe authors would find it necessary to present their data more carefully.Without "literate scientific data presentation", is there anythingjournals can do to help their data being included in the VO? We think so.Firstly, they should use as many tables as possible. It is easier to harvestinformation from tables than from text. Format the tables for machinesor provide a machine­readable version as well, and make allowancesfor VOTable conversion, e.g. including UCDs, maybe in a way thatthey do not appear in print. A few selected tables at IBVS are alreadyavailable in VOTable form as well.Secondly, journals can encourage authors to submit data they ploton figures in tabular form as well (electronic journals can storelots of supplementary material). Furthermore, it would be important to have all tables, figures,data files published in a journal accessible and addressable.At IBVS, all published figures can be re­used, included in other services, by using a unique identifier composed of the issue and figure numbers, e.g.  http://www.konkoly.hu/cgi­bin/IBVSfigure?5656­f1&Format=compactFor this, every figure, table and data file needs meta­informationincluding some special keywords. We intend to add database­like functionality to the electronic IBVS Holl (2004a). Thecontent of a journal article is static after publication (exceptfor the possible errata, the existence of which should be indicated).On the other hand, meta­data should be dynamic. At IBVS we have taken efforts to identify "anonymous" objects in oldpapers, and update the meta­data files with modern identifiers.Finally, good markup could also expedite metadata harvesting.An example is the \SIMBADobj LaTeX  macro at IBVS.­ Observatory publications and archivesObservatory publication series should be continued (Holl & Vargha 2003).We argue that observatory publications should go hand­in­handwith observatory archives. In the past, huge datasets and catalogswere published in observatory publications. This can only be doneelectronically now. But electronically published catalogs ­ as librariansknow very well ­ lack something paper catalogs have. Electroniccatalog handling systems, like Vizier at CDS, often discard oldversions superseded by new ones. And authors citing electroniccatalogs or tables often do not use unique computer identifiers, butpublication dates instead. We find it useful to keep the oldway of publication year, series, volume for reference, and havea handle for every electronic catalog on the library shelves too (which could be entirely virtual). Electronic catalogs benefit from having a publication counterpart, but observatory publications, on the other hand, should become electronic (not excluding, even recommending a printed version). Creating and maintaining meta­information is an essential task forobservatory publications and data archives alike. Librarians mighthave an active role in this ­ this is where they have considerableexpertise. As for the contents of the websites, archiving isa relatively new concern. We have put electronic databases andcatalogs on­line, and by now we have suffered our first losses:databases and websites which ceased to be accessible, or notmaintained any longer. We need librarians to keep essentialinformation in these. Publishing some descriptions of these electronicresources in observatory publications might be a way of archivingbits of these resources.There is an important lesson we can learn from the Open Archives /Open Access community. Observatories now can get shrink­wrapped software, to maintain publications electronically, like EPrints (University ofSouthampton) or DSpace (MIT). OAI technologies for metadata harvesting could be used.We would need similar software for data archives. Small observatoriescannot afford to build their VO compatible archives ­ there isneed for easy­to­install and ­maintain ready­made software, intowhich CCD direct frames or spectra could be uploaded, and which provide,besides the basic database functionality, communication with theVO with standard protocols like ConeSearch and others. A possible candidatesoftware for this task is SAADA developed at Strasbourg Observatory (Nguyen 2004). EPrints and DSpace could also be used for data repositories ­ its applicability in astronomy should be investigated. ­ Data repositoriesIs there a need for repositories which would accept small datasetsfrom professionals, or others open for amateurs? We think the answeris yes. NCSA started a kind of repository years ago: the NCSA Astronomy Digital Image Library (Plante 1996) It was created to store fully processed images, and is populated with arelatively small amount of nice pictures mainly from thefield of radio astronomy. The repositories we propose would storenot only nice images for outreach, but could archive and open upfor secondary usage of reduced CCD frames or spectra from any professional observatory. The advances in technology would make it feasible tostore all amateur CCD images submitted in a proper format and being equippedwith the necessary meta­information. The application of EPrints or DSpace could be considered here as well.The crucial question here is quality. But we believe that forsimple data ­ like direct CCD frames ­ quality control could be built inthe process. ­ Annotated VO archivesIn variable star astronomy there are large datasets of time seriesphotometry available for the public,  like NSVS which is available through SkyDOT (Starr 2003) or ASAS (Pojmanski 2003). These contain photometry which was processed automatically,searching for new variable stars. Lightcurve parameters assignedby pipeline processing are far from being accurate, and the variabilityof great many objects remain undetected by the software. Amateursand professionals mine these open databases, finding further variablesand refining (or completely changing) the classification and parametersof others. Results of such investigations appeared frequently in IBVS.The caveats can be clearly seen: while some researchers (amateursand professionals) with proper knowledge and care produce good sciencefrom such data mining, others derive questionable or poor results.Results of the utilization of publicly available data could be fedback to the VO through the journals, like IBVS. Another interestingpossibility is direct feedback to the open database in the fashion ofthe popular Wiki. The important question is, again the quality control ­ such feedback should only be allowed for selected researchers probably.Acknowledgements: The author is grateful to "Friends of LISA V" for theirhelp.ReferencesAccomazzi, A., Eichhorn, G., 2004, ASPC, 314, 181  Holl, A., 2004, ASPC, 314, 229 Holl, A., 2004, AN, 325, 610 Holl, A., Vargha, M., 2003, in: Library and Information Services in Astronomy,eds.: Corbin, B., Bryson, E., Wolf, M., U.S. Naval Obs., p. 109 Knuth, D., 1984, The Computer Journal, 27, 97 Nguyen, N.H., Michel, L., Motch, C., 2004, ASPC, 314, 121 Plante, R.L., Crutcher, R.M., Sharpe, R.K., 1996, ASPC, 101, 581 Pojmanski, G. 2003, Acta Astronomica, 53, 341 Starr, D., Wozniak, P., Vestrand, W. T. 2003, in ASP Conf. Ser. Vol. 295,Astronomical Data Analysis Software and Systems XII, ed.H. E. Payne, R. I. Jedrzejewski & R. N. Hook (San Francisco: ASP), 85 Sterken, C., 2000, IBVS, No. 5000 Weinberg, A.M., 1961, Science, 143, 161

Observations and Publications in the VO: Is the VO Only for Big Science?

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

Repository of the Academy's Library