Funkcionális genomikai rendszer kidolgozása gyermekkori acut lymphoid leukémiában DNS és cDNS chip analízis valamint immunfenotipizálás alapján = Development of a novel functional genomic system in pediatric acute lymphoid leukemia based on DNA and cDNA chip analysis as well as immunophenotyping

Abstract

Olyan molekuláris markerek genomikai identifikálását tűztük ki célul, melyek a gyermekkori akut limfoid leukémia (ALL) patomechanizmusának felderítésében, osztályzásának pontosításában és a kezelésre adott válasz predikciójában szerepet játszhatnak. A blaszt-minták gyűjtésének akadályozottsága miatt projektünkben a génpolimorfizmusok vizsgálata kapott fő hangsúlyt. Létrehoztunk egy nemzetközi viszonylatban is kimagaslóan nagynak számító biobankot ALL-es és osteosarcomás gyermekek továbbá egészséges véradók genomi DNS-mintáiból. Az ABCB1 1236C/T, 2677G/T,A és 3435T/C, ABCC1 2012G/T, ABCC2 1249G/A és 3563T/A, ABCC3 -211C/T, ABCG2 34G/A és 421C/A, SLC19A1 80G/A és GGH -401C/T génpolimorfizmusok meghatározását végeztük, és korreláltattuk a betegek adataival. Eredményeink szerint az ABCB1 és ABCG2 vizsgált polimorfizmusai nem hajlamosítanak ALL kialakulására. Megállapítottuk, hogy az ABCB1 3435T/C genotípus prediktív értékkel bír a vizsgált kemoterápiás protokoll kapcsán kialakuló immunszuppresszió vonatkozásában. Az ABCB1 3435TT genotípus és az ABCG2 421A allél hordozása szinergisztikus interakció révén hajlamosít a citosztatikus szerek központi idegrendszeri mellékhatásaira ALL esetében. A GGH 401TT genotípusú betegek metotrexát-eliminációja gyorsabbnak bizonyult mind az ALL-es, mind az osteosarcomás betegek adagolási sémája esetén, és súlyos szövődmények is ritkábban lépnek fel. Ezen eltérések alapját képezhetik a terápia-individualizációt előkészítő további tanulmányoknak | Our objective was to identify molecular markers in the genome that play important role in the pathomechanism, accurate classification and response to therapy in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). Given the fact that the collection of malignant blast samples was highly hampered, we mainly concentrated on studying somatic gene polymorphisms. A large DNA-biobank was established consisting of samples from pediatric ALL, osteosarcoma and healthy blood donors. The ABCB1 1236C/T, 2677G/T,A and 3435T/C, ABCC1 2012G/T, ABCC2 1249G/A and 3563T/A, ABCC3 -211C/T, ABCG2 34G/A and 421C/A, SLC19A1 80G/A, GGH -401C/T polymorphisms were genotyped and the association of genotype and clinical data were examined. In our study, the polymorphisms of ABCB1 and ABCG2 were not related to susceptibility to ALL. We found that the ABCB1 3435T/C genotype is predictive for the severe immunosuppression developed during the given ALL chemotherapy protocol. The ABCB1 3435TT genotype and carrying ABCG2 421A allele exert synergistic interaction in predisposing patients to the central nervous system adverse effects of cytostatic drugs in ALL. The elimination of methotrexate proved to be faster in patients of GGH -401TT genotype in case of both chemotherapy regimens used in ALL and osteosarcoma, and severe side effects of methotrexate was also more rare in this group. These results may lay the foundation of further studies to develop individual drug dosing protocols