Onkogenomikai kutatás melanomában génexpresszió és a nem kódoló microRNS profil meghatározása alapján = Oncogenomic studies in melanoma through gene expression and non-coding microRNA profiling
Kutatásukban mikroRNS (miRNS) expressziót vizsgáltak a melanoma sejtvonalakban, szövetmintákban és melanocyta sejtekben. Céluk a melanoma komplex keletkezési és fennmaradási mechanizmusában a miRNS profil felvételével új, melanomában eddig még nem leírt, a normáltól eltérő expresszió –szabályozási hálózat keresése, amely a daganat biológiai viselkedésének hátterében állhat, tükrözve a genetikai és epigenetikai tényezők komplexitását. A talált miRNS-ek lehetőséget adhatnak a célzott génterápia bevezetésére. Eredmények: 1. A melanoma sejtvonalak miRNS összetétele eltér a normál bőr melanocitáiktól 2. Egy, sok tumorban megtalálható miRNS, a miR21 bejuttatása sejtekbe önmagában nem okoz lényeges funkcionális hatást 3. Eltérést találtak a melanoma szövetminták és a melanoma vonalak miRNS mintázatában 4. Útvonalanalízis eredményeképpen egyes molekuláris jelutak (génhálózatok) kiemelt jelentőségét ismerték fel melanomában (elsősorban a p53 út) 5. Informatikai eszközökkel célpont predikciót végeztek. Kimutatták, hogy a melanoma szövet közelében található hízósejtekben a miRNS- 132 nagyon erősen gátló hatású, amely egy új génterápia lehetőségét veti fel. | In the present research mikroRNA (miRNA) expression was analysed in melanoma cell lines, tissue and melanocytes. Our goal was to uncover the complex mechanism of the miRNA action, specific on the regulatory network of the tumor reflecting the underlying epigenetic factors. Based on these findings a novel miRNA-targeted gene therapy may provide new opportunities. Results: 1. The melanoma cell lines differ in the composition of the miRNA from that of the melanocytes of healthy skin 2. A common miRNAs, miR21 transfected alone into cells does not cause a significant functional effect 3. Differences were found in the pattern of miRNA between melanoma tissue samples and established melanoma cell lines 4. The pathway analysis of the molecular signal processes proved the utmost importance of p53 pathway. 5. Mast cells occur in close vicinity of melanoma. Based on target prediciton screening miRNA-132 was selected. This miRNA reveals a very strong inhibitory effect, which raises the possibility of a new gene therapy
