CORE
🇺🇦
make metadata, not war
Services
Services overview
Explore all CORE services
Access to raw data
API
Dataset
FastSync
Content discovery
Recommender
Discovery
OAI identifiers
OAI Resolver
Managing content
Dashboard
Bespoke contracts
Consultancy services
Support us
Support us
Membership
Sponsorship
Community governance
Advisory Board
Board of supporters
Research network
About
About us
Our mission
Team
Blog
FAQs
Contact us
Screening, cloning and expression analysis of immune-relevant genes in Chinese soft-shelled turtle Trionyx sinensis
Authors
周秀霞
Publication date
5 June 2009
Publisher
Abstract
摘 要 本研究在最为薄弱的爬行动物免疫学研究领域进行了有意义的探索。应用抑制性差减杂交技术,首次构建了一个与嗜水气单胞菌 (Aeromonas hydrophila) 感染有关的中华鳖 (Trionyx sinensis) 主要内脏器官的差减cDNA文库。从200多个克隆中筛选到42个差异或上调表达的基因,其中16个与免疫相关基因系爬行类首次鉴定。经虚拟Northern 杂交和RT-PCR验证,其中的6个基因(IL-8、SAA、CD9、ATF4、CL和毒素样蛋白)在中华鳖感染组织均上调表达。 通过RACE方法得到中华鳖IL-8、SAA、毒素样蛋白、CD9和Fg基因的全长cDNA序列并进行了分子结构和进化分析;通过Genome Walking方法得到前3个基因的基因组及启动子序列。中华鳖IL-8基因组全长4924 bp,由三个内含子和四个外显子组成;cDNA全长为1188 bp,开放阅读框包含312 bp,编码蛋白为104个氨基酸,含有保守的CXC结构域、4个半胱氨酸和与功能相关的ELR基序。SAA基因组全长3153 bp,由两个内含子和三个外显子组成;cDNA全长为554 bp,开放阅读框包含381 bp,编码蛋白为127个氨基酸,C-端氨基酸十分保守,N-端由疏水氨基酸组成。毒素样蛋白基因组全长1995 bp,由两个内含子和三个外显子组成;cDNA全长为580 bp,开放阅读框包含267bp,编码蛋白为89个氨基酸,含有8个保守的半胱氨酸和三指蛋白家族的标志序列C-末端CCXXXCN基序。CD9 cDNA全长为1146 bp,开放阅读框包含672bp,编码蛋白为224个氨基酸,包含四个跨膜结构域(TM)和大小两个胞外环(LEL和SEL),LEL内含有保守的CCG基序和4个半胱氨酸,SEL内含一个N-端糖基化位点。Fg cDNA全长为1605 bp,开放阅读框包含1320bp,编码蛋白为440个氨基酸,含有FReD结构域、N-末端球形结构域C-gamma、Ca2+结合位点和聚合口袋结构等。系统进化分析显示,除毒素样蛋白与一种美洲大毒蛇的毒素样蛋白聚为一支外,其余四个蛋白均与鸟类的同源分子聚为一支。 RT-PCR分析显示在中华鳖相关组织中均检测到IL-8、CD9和毒素样蛋白基因的转录产物。其中IL-8基因为组成型表达;CD9基因主要在肝和脾组织表达;而毒素样蛋白基因主要在肝和肾组织中表达。RT-PCR结果表明,除SAA外,其余4种急性期蛋白(APP)Fg、C3、ALB和 CL基因均在肝组织表达。 通过RQ-PCR,发现在嗜水气单胞菌感染条件下,IL-8、CD9和毒素样蛋白在中华鳖相关组织中呈现动态表达变化。其中IL-8基因于感染后第4天以肝、脾和肾组织上调表达最明显;而CD9基因在2-4天以肝、脾和血液上调表达最明显;毒素样蛋白基因于感染后第1–2天以肝、脾、心脏和血液上调表达最明显;除ALB基因下调表达外,其它4种APP基因在肝组织均有不同程度的诱导表达,其中SAA于感染后第2天在肝组织上调至2000倍;表明这些基因的表达变化与爬行类抗细菌免疫密切相关。 完成了中华鳖IL-8基因的原核表达和蛋白纯化。趋化实验表明,rIL-8蛋白浓度为1.0―20ng/ml时对中华鳖嗜中性粒细胞有趋化作用,对淋巴细胞趋化作用不明显。首次证实了爬行动物rIL-8对嗜中性粒细胞的趋化作用
Similar works
Full text
Available Versions
Institute of Hydrobiology, Chinese Academy Of Sciences
See this paper in CORE
Go to the repository landing page
Download from data provider
oai:ir.ihb.ac.cn:342005/12492
Last time updated on 15/03/2018