Analiza točnosti iterativnog pretraživanja

Abstract

U ovom radu bavimo se metodom za iterativno traženje motiva u nekom proteomu ili velikom skupu proteinskih nizova. Ocjenu sličnosti motiva i podniza definirali smo kao logaritam omjera nekih vjerojatnosti i ustanovili da su dobivene vrijednosti logistički distribuirane. Koristeći mjere raspršenosti ili varijabilnosti, analizirali smo dobivene rezultate i povezali te mjere s preciznošću i osjetljivošću iterativne metode.In this work, we are concerned with an iterative motif scanning method. We defined the similarity score in terms of a log-odds ratio, and established that the scores tend to be logistically distributed. We analyzed our results in terms of dispersion measures and established a connection of these measures with sensitivity and specificity of the iterative procedure