Belay, G.

Dessie, Tadelle

Ekaya, Wellington N.

Githae, D.

Hanotte, Olivier H.

Jung'a, J.O.

Kebede, A.

Kyalo, Martina

Pelle, Roger

Spark, N.

Tesfaye, K.

CGSpace

Key messages• Indigenous chicken are locally adapted to environmental challenges and provide subsistence to millions of farmers in Africa• Their productivity remained low compared to exotic chicken strains• African Chicken Genetic Gain project (https://africacgg.net) works to combine the local adaptation of indigenous chicken with productivity traits of exotic chicken• Here, we report the diversity characterization of a genetic marker‐ LEI0258 found within the chicken major histocompatibility complex (MHC) regions in 14 different chicken populations (Figure 1)• Genetic variation at the marker has been linked to infectious diseases resistance/susceptibility in commercial breedsLivestock‐based solutions• Understanding the link between genetic diversity and environmental challenges is opening the door to marker‐assisted breeding improvement programs for sustainable increasing poultry production at smallholders farmer levelPartnersDiversity of LEI0258 microsatellite locus in indigenous Ethiopian chickens1,2,3 Adebabay Kebede, 3Olivier Hanotte, 3Tadelle Dessie, 4 Nick Spark, 1Gurja Belay, 1 Kassahun Tesfaye, 5 Joseph O Jung'a, 6Martina Kyalo,  6Dedan Githae, 6Wellington Ekaya, 6 Roger Pelle1Addis Ababa University 2Amhara Regional Agricultural Research Institute3 International Livestock Research institute (ILRI) 4Centre for Tropical Livestock Genetics (CTLGH), The Roslin Institute, University of Edinburgh5University of Nairobi 6Biosciences eastern and central Africa (BecA)‐ILRI Hub7th Multi-Stakeholder Partnership MeetingAchieving multiple benefits through livestock-based solutions, Addis Ababa, 8-12 May 2017ContactAdebabay KebedeILRI, Ethiopiaa.kebede@cgiar.orgThis document is licensed for use under the Creative Commons Attribution 4.0 International Licence. May 2017Results and evidence• Thirty LEI0258 alleles size were observed in 282 chicken from 14 populations on gel electrophoresis (Figure 4)• Allele size ranges from 185–569 bp with no significant difference in allele frequencies between populations• Allele frequencies were in Hardy and Weinberg in all population except in improved Horro and Dara (P < 0.05)• Sequencing of some selected alleles has increased the total number of alleles to 37Conclusions• Very high diversity was found in Ethiopian indigenous chicken populations at LEI0258, this diversity is observed within the whole population• Our results support the importance of MHC diversity in response to the disease challenges faced by smallholder poultry production in Ethiopia• Breeding improvement programs will need to maximize this diversityFig 3. Chicken producers in pastoral systemsFigure 2. Chicken producers in crop‐livestock production systemsFigure 4. PCR amplicons of alleles in indigenous chicken of EthiopiaWe thank all donors and organizations which globally support its work through their contributions to the CGIAR systemFigure  1. Chicken sampling sites across the country

Diversity of LEI0258 microsatellite locus in indigenous Ethiopian chickens

https://cgspace.cgiar.org/bitstream/10568/89135/1/gasl_adebabay_may2017.pdf

Diversity of LEI0258 microsatellite locus in indigenous Ethiopian chickens

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