The role of Epstein-Barr virus stable intronic sequence-RNAs in early B Cell infection

Abstract

Epstein-Barr virus (EBV) is a gamma-herpesvirus that infects epithelial cells and naïve B cells. With a prevalence of about 95% in the world population, it is generally acquired during childhood or adolescence and is responsible for a non-threatening clinical condition called infectious mononucleosis. However, particularly in the immunosuppressed this virus is implicated in the pathology of lymphomas and some carcinomas. The presence of EBVencoded stable intronic sequence RNAs in EBV-positive cell lines was detected for the first time in 2013 and their role in the EBV’s life cycle is not yet known. Here is reported the generation of the first virus knock-out virus for sisRNA-1 and the preliminary study of the virus’ behaviour in B cell infection. Evidence found by monitoring cell proliferation through microscopy and FACS analysis shows that knocking out the intron that encodes sisRNA-1 causes proliferation impairment by day 8 after B cell infection, but doesn’t impede later proliferation and outgrowth of LCLs. Viral transcription of LMP1 and Cp vs Wp promoter usage was analysed as well as viral protein expression of the EBNAs but no significant differences between WT and sis1KO where found. It remains to be determined if the effects observed where in fact a consequence of the lack of sisRNA-1 or due to the disruption of BHRF1 splicing that we hypothesised to be a possible consequence of deleting sisRNA-1.O vírus Epstein-Barr é um gamma-herpesvirus que infecta células epiteliais e células B “naive”. Com uma prevalência de cerca de 95% na população mundial, é geralmente adquirido durante a infância ou adolescência, sendo responsável por uma condição clínica, designada mononucleose infeciosa, que não ameaça a vida. No entanto, particularmente em indivíduos imunodeprimidos este vírus está implicado no aparecimento de linfomas e de alguns carcinomas. A presença de “stable intronic sequence RNAs” (sisRNAs) codificados pelo EBV foi detectada em linhas celulares EBV-positivas pela primeira vez em 2013 e a sua função no ciclo de vida do vírus tem sido até agora desconhecida. Aqui é reportada a produção do primeiro vírus knock-out para o sisRNA-1 e o estudo preliminar do seu comportamento na infecção de células B. Os resultados obtidos a partir da monitorização da proliferação celular e análises de FACS revelaram que a delecção do intrão codificado pelo sisRNA-1 causa um atraso na proliferação celular no dia 8-pós infecção de células B, mas não impede a proliferação mais tardia e a formação de LCLs. A transcrição de genes virais como o LMP1 e a utilização dos promotores Cp vs Wp, bem como a expressão de proteínas virais foram analisadas, mas nenhuma diferença significativa foi encontrada entre os vírus WT e o sis1KO. Permanece por determinar se os efeitos observados são de facto uma consequência do sisRNA-1 ou da disrupção do “splicing” de BHRF1 que consideramos ser uma consequência possível da delecção do sisRNA-1

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