Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü
Abstract
Bambara yer fıstığı (Vigna subterranea, 2n = 2x = 22), çoğunlukla Afrika'nın kurak ve
yarı kurak bölgelerinde yetiştirilen yerli baklagil bitkisidir. Yüksek miktarda protein
içerdiğinden dolayı çok besleyici bir üründür. Bununla birlikte, bu baklagil bitkisi
üzerindeki çalışmalar son derece sınırlıdır. Bu çalışma, ayrıntılı kromozom
çalışmalarına temel teşkil etmek amacıyla bambara yer fıstığı sentromer DNA dizisi
hakkında temel bilgiler sağlamayı amaçlamaktadır. Bu araştırma için Nijerya'dan
tohumlar kullanıldı. Elde ettiğimiz sonuçlar bambara yer fıstığının, börülce (V.
unguiculata)’de tespit edilen 455 bazçifti (bç) sentromerik DNA tekrarları ile yüksek
DNA dizi benzerliğine sahip olduğunu göstermektedir. DNA sekans sonuçlarından,
klonların boyutlarının börülce genomundaki 455 bç sentromerik DNA tekrarlarından
daha az olduğunu göstermiştir. Ayrıca DNA dizi sonuçları içerisinde hiçbir alt motif
veya tekrar tespit edilmemiştir. Metafaz kromozom hazırlanmasından, metasentrik ve
submetasentrik kromozomlar daha az yapısal değişkenlik ile gözlenmiştir. Bu çalışma
sonucunda, DAPI boyaması ve sentromerik DNA klonlanmasıyla dizi analizi yapılarak
somatik metafaz kromozomlarının hazırlanması için etkili bir yöntem geliştirmiştir.
Anahtar Sözcükler: Bambara yer fıstığı, DAPI boyama, klonlam, sentromerik DNA, tandem tekrarlarBambara groundnut (Vigna subterranea, 2n = 2x = 22) is an indigenous leguminous
crop cultivated mostly in the arid and semi-arid regions of Africa. It is a very nutritious
crop since it contains a high amount of protein. However, studies on this pulse crop are
very limited. This study is aimed at providing fundamental knowledge on bambara
groundnut centromere DNA sequence for further chromosome studies. In this regard,
seeds of bambara groundnut were obtained from Nigeria for the research. The results
indicate that bambara groundnut has a higher pairwise similar identity with that of 455
bp centromeric DNA repeats of cowpea. There was no internal motif/repetition from the
DNA sequencing indicating that the sizes of the clones were lesser than the 455 bp
centromeric DNA repeats in cowpea. From the metaphase chromosome preparation,
metacentric and sub-metacentric chromosomes were observed with less structural
variability. The sizes of the chromosomes were smaller making it relatively impossible
to identify the homologous pairs. This study has successfully developed an efficient
method for the preparation of somatic metaphase chromosomes using DAPI staining
and sequence analysis by cloning of centromeric DNA.
Keywords: Bambara groundnut, centromeric DNA, cloning, DAPI staining, tandem repeat