Etiology of invasive and subcutaneous fungal infections: analysis of data from the National Network for Laboratory Surveillance of Invasive and Subcutaneous Fungal Infections (IFIs), 2013-2018

Abstract

A epidemiologia das infeções fúngicas invasivas tem vindo a alterar-se com o surgimento de novos agentes etiológicos. A Rede Nacional de Vigilância Laboratorial de Infeções Fúngicas Invasivas e Subcutâneas (IFI) teve início em 2013 com o objetivo de melhor compreender a epidemiologia destas infeções em Portugal. O objetivo deste estudo é analisar os dados obtidos através da Rede entre junho de 2013 e setembro de 2018. Os laboratórios participantes asseguram a comunicação dos casos de IFIs ao Laboratório Nacional de Referência do INSA, enviando amostras biológicas ou isolados, acompanhados de um inquérito contendo informações demográficas, laboratoriais e avaliações clínicas dos doentes com suspeita de infeção fúngica. O estudo incluiu: i) casos de infeção fúngica invasiva (IFI) por fungos filamentosos/dimórficos, ii) casos de IFI provável, de acordo com os critérios estabelecidos pelo EORTC/MSG 2008, e iii) casos de infeções fúngicas subcutâneas. As infeções por leveduras não foram incluídas. Entre junho de 2013 e setembro de 2018, foram incluídos 52 casos, distribuídos da seguinte forma: IFI comprovada (por fungos filamentosos) (n=9); Infeção fúngica subcutânea (n=17); Infeção por fungos dimórficos endémicos (n=9), totalizando 67% de casos de IFI comprovados (n=35) e 33% de casos IFI provável (n=17). Os dados obtidos chamam a atenção para a grande diversidade de espécies envolvidas em infeções fúngicas profundas, com implicações para o diagnóstico clínico/laboratorial bem como para o tratamento destas infeçõesThe epidemiology of deep fungal infections has been changing with the emergence of new species as etiological agents. The National Laboratory Surveillance Network for Invasive and Subcutaneous Fungal Infections (IFIs) began in 2013 with the aim of better understanding the epidemiology of invasive and subcutaneous fungal infections in Portugal. The goal of this study is to analyse the data obtained from this Network between June 2013 and September 2018. The participating laboratories ensured the reporting of suspected or confirmed IFIs cases to the National Reference Laboratory of INSA, by sending biological samples or isolates, accompanied by a survey containing demographic information, laboratory and clinical evaluation of patients with suspicion of having an IFIs. The study included: i) cases of invasive fungal infection (IFI) caused by filamentous/dimorphic fungi, ii) cases of probable IFI, according to the criteria established by EORTC/MSG 2008, and iii) cases of subcutaneous fungal infections. Yeast infections were not included. Between June 2013 and September 2018, 52 cases were included. The cases were distributed as follows: Proven IFI (by filamentous fungi) (n=9); Subcutaneous fungal infection (n=17); Infection due to endemic dimorphic fungi (n=9), totalizing 67% of proven IFI cases (n=35) and 33% of probable IFI cases (n=17). The obtained data raise the awareness to the great diversity of species involved in deep fungal infections, with implications to the clinical/laboratory diagnosis of these infections as well as their treatment.info:eu-repo/semantics/publishedVersio