INSaFLU — an online bioinformatics platform for genome-scale analysis of influenza virus: an innovative contribution for the worldwide flu surveillance

Abstract

A vigilância laboratorial da gripe entrou numa nova era marcada pela análise e caracterização do vírus da gripe à escala do seu genoma completo. Este ar tigo resume o contexto inerente ao desenvolvimento e à aplicação da plataforma bioinformática online INSaFLU (“INSide the FLU”) (https://insaflu.insa.pt/), a qual consiste na primeira ferramenta bioinformática online gratuita especificamente criada para permitir que qualquer laboratório do mundo possa integrar facilmente a análise genoma do vírus na vigilância e investigação da gripe. Este avanço científico constitui um importante alicerce para a operacionalização de uma vigilância à escala global harmonizada pelo uso da sequência do genoma total do vírus da gripe.A new era of laboratory flu surveillance has already started based on the genome-scale analysis and characterization of the causative agent, the influenza virus. This article summarizes the context behind the development and application of “INSaFLU” (“INSide the FLU”) (https://insaflu.insa.pt/), which is the first influenza-oriented bioinformatics platform that allows any laboratory in the world to analyze the genome of the influenza virus in a user-friendly manner towards the generation core “genetic requests” for an effective and timely flu laboratory surveillance. INSaFLU supplies public health laboratories and influenza researchers with an open “one size fits all” framework, potentiating the operationalization of a harmonized multicountry WGS-based surveillance for influenza virus.info:eu-repo/semantics/publishedVersio