Com a fase analítica estritamente controlada, o objetivo dos laboratórios deverá voltar-se para a qualidade das amostras analisadas e para a segurança dos procedimentos na fase pré-analítica. Para tal, o laboratório deverá integrar procedimentos de controlo de qualidade interno e de avaliação externa da qualidade na rotina laboratorial, implementando ferramentas adequadas para a deteção, monitorização e redução/eliminação de erros cujo efeito tenha um impacto negativo significativo na qualidade da amostra com repercussão nos resultados laboratoriais e na saúde do técnico e do utente.
O Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade (PNAEQ) disponibiliza várias ferramentas aos laboratórios inscritos no programa de Avaliação da Fase Pré-Analítica que, quando utilizados de forma contínua na rotina laboratorial, permitem ao laboratório realizar o controlo de qualidade interno da fase pré-analítica.N/