The pattern of financial management institution had to be accountable as one indicator of university management assessment as a whole. This study examined the management of higher education in terms of the implementation of Good University Governance (GUG). GUG concept was adopted from the concept of good corporate governance. The samples were state universities in Central Java and Yogyakarta using purposive sampling technique. Data analysis used was Structural Equation Model (SEM) analysis based on Path Analysis. The results showed that GUG directly influenced the Cultural Organization (CO), and Organizational Structure (OS) affected the Financial Management Performance (FMP). However, GUG did not directly influence FMP, OS, and PM (Planning Management). PM and OS were proven not directly influence the FMP. Other evidence found was the indirect effect of GUG to FMP through OS, PM, and CO. The conclusions of this research were GUG would increase CO and OS and would further increase FMP. Thus, universities should consider the implementation of GUG to increase the performance of financial management. Pengelolaan keuangan yang akuntabel merupakan salah satu indikator yang baik untuk menilai pengelolaan perguruan tinggi secara keseluruhan. Penelitian ini mengkaji pengelolaan perguruan tinggi yang ditinjau dari Implementasi Good University Governance (GUG) yang merupakan adopsi konsep Good Corporate Governance di sektor korporasi. Penelitian ini menggunakan sampel Peguruan Tinggi Negeri di Jawa Tengah dan Daerah Istimewa Yogyakarta dengan menggunakan teknik purposive sampling. Analisis data menggunakan model Structural Equation Model (SEM) berbasis Analisis Jalur (Path Analysis) untuk menjawab tujuan dan hipotesis penelitian. Hasil penelitian menunjukkan variabel GUG terbukti berpengaruh secara signifikan terhadap struktur organisasi, manajemen perencanaan, dan kinerja manajemen keuangan. Variabel struktur organisasi dan manajemen perencanaan juga terbukti berpengaruh secara signifikan terhdap kinerja manajemen keuangan. Namun, variabel GUG tidak terbukti berpengaruh siginifikan terhadap budaya organisasi dan variabel budaya organisasi tidak terbukti berpengaruh signifikan terhadap kinerja manajemen keuangan. Hasil berikutnya adalah variabel GUG terbukti berpengaruh secara tidak langsung terhadap kinerja manajemen keuangan melalui budaya organisasi, struktur organisasi, dan manajemen perencanaan. Hal ini menunjukkan bukti bahwa perguruan tinggi harus mempertimbangkan implementasi GUG untuk meningkatkan kinerja manajemen keuangannya