Universidad Autonoma de Yucatan. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia
Abstract
En Colombia el ganado Holstein, es una de las principales razas usadas para la producción lechera, por lo que identificar señales de selección reciente, puede ser de gran importancia para la producción de lácteos, de acuerdo con lo anterior el objetivo principal de este trabajo fue, identificar señales de selección reciente en el cromosoma 6 para ganado Holstein de Antioquia, mediante la metodología IHS. Para tal fin se utilizaron 145 animales para la extracción de DNA de sangre o semen mediante kit comercial, posteriormente se genotiparon los animales con el chip BovineLD (Illumina), que cuenta con un total de 6909 SNPs, se conservó sólo la información del cromosoma 6 que mapeaba en el ensamblaje bovino UMD 3.1 y se determinaron las señales de selección reciente mediante la metodología iHS. Además se realizó un modelo lineal generalizado para determinar el efecto de los marcadores con mayor señal de selección sobre la producción láctea, el porcentaje de proteína y de grasa. En total solo 2 marcadores focales para el cromosoma 6 fueron significativos (p<0.001) para las señales de selección, en las cuales se encontraron algunas regiones importantes que estuvieron asociadas con genes como, CSN1S1, CSN2, CSN1S2, CSN3) que en general se encuentran relacionados con funciones de estabilización de micelas de caseína para formación de proteína en la leche. Otro gen importante fue GnRHR (Receptor de gonadotropina), mediador en la liberación de la LH y FSH. Se encontraron frecuencias alélicas intermedias en los dos marcadores con señal de selección y uno de los marcadores presentó una asociación positiva con el porcentaje de proteína láctea, lo que coincide con un QTL previamente reportado
