Le couple CoreBook / Cyber-Carothèque Nationale : un système de collecte et de gestion d’information dédié aux carottes sédimentaires marines et continentales.

Abstract

PosterInternational audienceLa gestion des données constitue l’un des défis de l’Open science dans le contexte de la loi « Pour une république numérique ». Ceci est particulièrement important dans le domaine des sciences de la Terre et de l’environnement dans lequel la multiplication des échantillons de terrain et de mesures qui sont réalisées sur chaque conduit à une croissance exponentielle du nombre de données. Dans le cas de l’étude des carottes sédimentaires, l’engouement pour les méthodes paléoenvironnementales, pour répondre à des problématiques variées allant des chroniques de contaminations récentes aux évolutions climatiques pluriséculaires à plurimillénaire, voire plus, participe de cette croissance. Or, l’absence de systèmes d’information dédiée ne permet pas de capitaliser sur cette grande richesse en reliant les données entre elles.Dans cette contribution, nous présentons un système développé dans le cadre du programme Equipex CLIMCOR afin de bancariser les informations de terrain collectées lors du prélèvement de carottes sédimentaire. Ce système est constitué de deux modules : i) CoreBook, qui est une application mobile de collecte d’information sous Android et ii) la Cyber-carothèque nationale (Base MySQL), qui est un portail d’import, de consultation et de diffusion des informations.CoreBook a été pensé pour être embarquée sur une tablette durcie du commerce. Elle apporte une plus-value lors des opérations de carottage sur le terrain. Il comprend notamment des fonctionnalités comme le repérage des carottages précédents, une aide à la navigation et aux opérations d’ancrage ou encore la visualisation en coupe des carottages multi-sections et/ou multi-trous, ou en carte des carottages simple section. Optimisé pour la carottage multi-sections multi-séquences, il est adapté à tout type de méthode de carottage (carottier russe, gravitaire, piston stationnaire, etc.). Chaque entité de recherche (labo) a la possibilité de créer des configurations de matériels dans le portail « Cyber-carothèque » en constituant un référentiel qu’il retrouvera dans le CoreBook ; ce référentiel facilite la sélection d’outils une fois sur le terrain et associe automatiquement les paramètres de carottage et d’outils aux futurs échantillons ce qui permet de gagner en précision et qualité. Les données collectées par CoreBook sont directement synchronisables avec la cyber-carothèque. Un format d’échange permettra également d’alimenter les bases de données locales de laboratoire. La cyber-carothèque permet de gérer les configurations matérielles des entités de recherche. Elle recueille les métadonnées des opérations de prélèvement de carottes, soit via CoreBook, soit via un fichier d’import respectant un format spécifique. Interopérable, elle est capable, via des web-services, de moissonner des bases existantes et d’être moissonnée par celles-ci par des protocoles standardisés (OGC WFS).Une fois entrée dans la Cyber-carothèque, chaque échantillon reçoit un identifiant unique au format international IGSN. Equivalent d’un DOI pour les échantillons géologiques, cet identifiant permet de tracer la carotte et les opérations de terrain ayant permis de la prélever, à chaque fois qu’elle est utilisée pour une publication ou intégrée dans un système d’information. Il s’agit d’une étape préalable indispensable vers la bancarisation, la qualité, le partage et la réutilisabilité des données.Pour l’utilisateur final, la Cyber-carothèque offre des fonctionnalités de recherche et constitue une base de référence, structurée, ouverte et standardisé permettant de connaître les échantillons déjà prélevés dans une région donnée, ou encore de suivre l’activité d’un groupe de chercheur ou d’une entité de recherche. En prenant le problème de la gestion des données à la base, au niveau des opérations de terrain, le système CoreBook & Cyber-carothèque fournit à la communauté scientifique nationale un socle solide pour développer des bases de données, soit pour la gestion interne des données et/ou des échantillons, soit pour évoluer vers des systèmes plus intégrés en associant de données analytiques. La Cyber-carothèque est accessible à l’adresse : https://cybercarotheque.fr/index.php, on y trouve notamment le lien et les instructions pour télécharger l’application CoreBook