Sri Yuliati

ETD - Unsyiah Central Library

ELECTRONIC THESIS AND DISSERTATION UNSYIAHTITLEKAJIAN MOLEKULER KARAKTERISTIK GEN CALPASTATIN (CAST) PADA KAMBING BOERKA (CAPRA HIRCUS)ABSTRACTKAJIAN MOLEKULER DAN KARAKTERISTIK GEN CALPASTATIN            (CAST) PADA KAMBING BOERKA (Capra hircus)ABSTRAKGen yang yang dapat mempengaruhi keempukan daging salah satunya adalah gen calpastatin (CAST). Tujuan penelitian ini adalahuntuk mengetahui karakteristik gen CAST pada kambing boerka secara molekuler. Sampel penelitian yang digunakan adalah darahyang diambil dari 5 ekor kambing boerka yang dipelihara di UPT Hewan Coba Universitas Syiah Kuala. Metode yang digunakanyaitu dengan polymerase chain reaction (PCR), elektroforesis dan sekuensing DNA. Gen CAST pada kambing boerka berhasildiamplifikasi dengan suhu 59Â°C sebesar 1552 bp. Sebanyak 5 sampel yang telah di PCR dilakukan sekuensing. Hasil sekuensingdianalasis menggunakan software program Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) dan Clustal W dari program Mega 6.01.Hasil analisis menunjukkan bahwa gen CAST pada kambing boerka memiliki kemiripan dengan gen CAST pada Ovis  aries danBos taurus. Karakteristik gen CAST pada kambing boerka diantaranya memiliki panjang pasangan basa yang dapat teramplifikasisebesar 1552 bp menggunakan suhu annealing 59Â°C dan memiliki kemiripan sekuen dengan gen CAST pada Ovis aries dan Bostaurus sesuai data yang ada di Genbank serta adanya variasi jarak genetik antar sampel kambing boerka.MOLECULAR STUDY AND CHARACTERISTICS CALPASTATIN(CAST)  GENE IN BOERKA GOAT (Capra hircus)ABSTRACTGenes that can affect the tenderness of one of them is the calpastatin (CAST) gene. The aim of this research was to find out thecharacteristic of CAST gene in boerka goats. The sample of research used blood collected from 5 boerka goats which kept in UPTHewan Coba Syiah Kuala University. The method used with polymerase chain reaction (PCR), elektoforesis and DNA sequencing.CAST gene on boerka goats was successfully amplified with a temperature of 59 Â° C for 1552 bp. A total 5 samples have been inPCR in sequencing. The results of sequencing in analytics using software Local Basic Alignment Search Tool (BLAST) and ClustalW program from Mega 6.01 program. The results showed that the CAST gene in boerka goats had similarities with the CAST genein Ovis aries and Bos taurus . Characteristics CAST gene in boerka goats such as having an alkaline pair length that can beamplified by 1552 bp using annealing temperature of 59 Â° C and sequence similarity with CAST gene on Ovis aries and Bostaurus according to existing data in Genbank and the variation of genetic distance between samples of boerka goats.                                  

KAJIAN MOLEKULER KARAKTERISTIK GEN CALPASTATIN (CAST) PADA KAMBING BOERKA (CAPRA HIRCUS)

http://etd.unsyiah.ac.id/pdf.php?id=40853

KAJIAN MOLEKULER KARAKTERISTIK GEN CALPASTATIN (CAST) PADA KAMBING BOERKA (CAPRA HIRCUS)

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

ETD - Unsyiah Central Library